正因为编制之上附加的种种好处，已经在公立医院拥有编制的医生不愿意离开，还未获得编制的医生则想进入编制，刚毕业的医学生在择业时，也更倾向于拥有编制的公立医院。在这一大环境下，民营医院根本无力与公立医院争抢人才，良性的医疗市场竞争格局无法形成。
在人社部定调之前，其实已有一些地区在编制改革上先走一步。
在河南等地改革中，财政下拨的“人头费”被改为“基本医疗服务补助”，不再跟编制数量挂钩。拨款主要根据服务数量和质量等综合考核结果进行分配。为了减轻改革阻力，河南省在改革拨款方式的同时，在往年基础上进一步提高财政拨款总额。
另外，将编制管理从审核制转向备案制。改变过去编制对应到具体岗位和具体个人的做法，主管部门只负责核定医院编制总量，事业单位可以自己定编定岗定人，只需向人事部门备案即可。
无论如何，将公立医院不纳入编制管理当然是正确方向，但更关键的改革应是完全削除原本依附于编制之上的种种显性或隐性福利，使得医生们不再有体制内外之别，这样才能促成人力资源流动和优胜劣汰，最终形成良性的医疗服务市场。
