长期以来，学校充分发挥学科优势，坚持自主创新，积极推动产学研结合，在科学研究、科技创新、科技成果转化等方面取得了显著成绩。学校现有“机电产品包装生物质材料国家地方联合工程研究中心”、“林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室”、“江苏省速生木材及农作物秸秆材料工程研究中心”、“江苏省南方现代林业协同创新中心”、“国家林业局南方林木种子检验中心”等49个省、部级研究开发机构、重点实验室和工程研究中心，有65个校级研究所和研究中心。学校每年在研课题1000多项，近年来，承担包括“973”、“863”、国家科技支撑项目、“948”项目和部、省重点项目累计800余项，国家自然科学基金累计400余项。通过鉴定的科研成果及批准专利1000余项，有337项成果获国家、部省级以上奖励，其中，国家发明一等奖1项，二等奖2项，三、四等奖各1项；国家自然科学奖二等奖1项；国家科技进步一等奖5项，二、三等奖42项；部、省级奖励285项。学校主办有《南京林业大学学报(自然科学版、人文社科版)》、《林业工程学报》和《室内设计与装修》等学术刊物，其中《南京林业大学学报》为中国核心期刊，《林业工程学报》已成为中国科技核心期刊。

学校占地面积10200亩，其中，新庄主校区占地1257亩，句容下蜀校区占地4370亩，南方学院淮安校区占地1327亩，白马教学科研基地占地3300亩，江宁工程培训中心等占地41亩。现有教学科研仪器设备总值6.45亿元，图书馆纸质文献总量为170万册，电子图书350多万册。校园网络以千兆带宽为主干，覆盖全校。

学校积极开展对外学术交流，与美国、德国、加拿大、英国、瑞典、俄罗斯、日本、意大利、芬兰、法国、伊朗等近20个国家的50多所高校或科研机构建立了广泛的学术交流和研究合作关系。学校具有招收外国留学生和港、澳、台学生的资质，积极推出学校品牌特色专业，吸引了一大批外国学生留学我校。为引进国外优质教育资源，经教育部批准，我校与加拿大UBC大学联合开办3+2双学位（本科）国际合作办学班。我校继续扩大对外开放，积极探索多形式、多层次的人才培养合作模式，与英国诺桑比亚大学、日本东京大学、法国洛林大学、瑞典皇家理工学院、德国弗莱堡大学、加拿大湖首大学等世界知名高等院校开展科研、教师培养等合作，同时与加拿大UBC大学、新布伦瑞克大学、美国阿拉巴马农工大学、秘西西比州立大学、芬兰坦佩雷科技应用大学开展国家留学基金委优秀本科生国际交流项目的派遣工作。与美国阿拉巴马农工大学合作共建的孔子学院，为我校深入开展多渠道、深层次、宽领域的国际合作与交流搭建了新的重要的平台。