初步形成了管办分开的组织架构。2010年，成立首都医药卫生协调委员会，加强了与中央部委、军队和武警系统的沟通联动，推进全行业、属地化管理。2011年，成立市医院管理局，初步实现了对市属医院的“管办分开”。

“管行业”与“办医院”职能分别得到强化。管办分开后，市卫生计生委出台了《北京市医疗机构设置规划(2012-2015年)》，积极研究制定《北京市医疗卫生服务体系规划(2016-2020年》、《“十三五”期间北京市医疗机构设置规划》，加强了对本市医疗相关技术、人员和机构准入的管理，在全市属地医院开展行业评价并向社会发布，行业管理职能得到了加强。市医管局对市属公立医院统一管理，建立和完善了市属医院人才培养和管理制度，建立了基于公益性的医院绩效考核制度，研究起草了市属医院下属企业监督管理办法、总会计师管理办法和考核办法、总药师岗位职责和遴选办法，“办医院”职能不断加强。

法人治理运行机制开展试点。2012年7月，在友谊医院与朝阳医院建立了医院理事会，理事会负责决策、院长负责执行、监事会负责的相互制衡的法人治理结构和治理机制初步形成。多元的理事构成，特别是外部理事的参与，使医院决策更具公益性、透明性和科学性。几年来，两家试点医院建立和完善了公立医院决策机制、执行机制、监督机制、用人机制、激励约束机制等“五项机制”。医院内部绩效考核与人事分配制度得以改进，医疗质量管理体系不断健全和完善。

二、破除“以药补医”机制，推进医保调节、价格调控、财政投入联动机制建立

友谊医院、朝阳医院等5家医院实施了医药分开改革试点，成功实现了取消药品加成、挂号费和诊疗费与实施了医事服务费之间的“平移转换”。参与改革的医院收入结构和激励机制得到优化，医务人员的技术劳务价值得到体现，医生用药行为更加合理。

医保付费方式组合发力。总额预付发挥约束激励机制。面对医疗费用增长过快以及对医保基金带来的压力，2011年在友谊医院、朝阳医院等4家医院开展医保基金总额预付试点，目前，总额预付已在本市二级以上医院全部实行。实施总额预付后，医院节约医疗成本的动力增强，医保基金过快增长的势头得到有效遏制。率先实行按疾病分组付费(DRGs)。在友谊医院、朝阳医院、北医三院等6家医院开展108个病组DRGs试点，建立了全国唯一可实施的诊断分组标准和付费方法。