三级医院甲类药品和国家基本药物、常用低价药使用比例需占药品总费用的60%以上;目录外药品使用比例不得超过药品总费用的10%。

蒙药、中药院内制剂实行申报制度，由医疗机构申报，经自治区卫生计生委审核后决定是否列入新农合报销药品目录，列入可报销范围的药品仅限在本院使用。

二、内蒙古新农合重大疾病保障方式

1、儿童先天性心脏病、急性白血病、重性精神病、终末期肾病、耐多药肺结核、布鲁氏杆菌病、唇腭裂7种重大疾病采取新农合单病种补偿方式;I型糖尿病、甲亢2种慢性疾病采取特殊门诊治疗补偿。单病种购买商业保险的12种疾病由商业保险公司补偿，实际补偿比例不低于70，补偿范围可以不受新农合药品报销目录和诊疗项目目录限制。

2、已出台单病种补偿政策的6种重大疾病按相关文件确定的补偿标准执行。

3、唇腭裂手术实行限价治疗，新农合报销70，其余部分积极争取其他慈善机构补助;I型糖尿病、甲亢两种慢性疾病的实际补偿比例累计不低于70%。

三、内蒙古新农合部分补偿方式

新农合基金部分补偿诊疗项目发生的费用，各级新农合定点医疗机构部分项目补偿比例由原来的60%提高到80%。心脏起搏器、人工晶体、人工关节、人工喉、人工股骨头、小儿人工耳蜗、小儿先心病手术体内置放材料、血管支架等体内置换的人工器官、体内置放材料及高值医用耗材等医用材料费用，国产的个人先自付部分由原来30%调整为20%，按80%计入可补偿费用，进口的个人先自付部分由原来60%调整为50%，按50%计入可补偿费用。

四、内蒙古新增报销药品

其所载药品共计1988个品种，其中西药1052种、中成药720种、民族药216种，单增肿瘤治疗药物4类29种。甲类药品和国家基本药物、常用低价药全额列入报销基数，其中国家基本药物可在各定点医疗机构原报销比例基础上提高10%，民族药(蒙药)可在原报销比例基础上提高15%;乙类药品按90%纳入报销基数。

五、内蒙古新农合保障人群

凡参加新农合的参合人，患儿童先天性心脏病、急性白血病、终末期肾病、妇女乳腺癌、宫颈癌、重性精神病、艾滋病机会性感染、耐多药肺结核、肺癌、食道癌、胃癌、结肠癌、直肠癌、慢性粒细胞白血病、急性心肌梗塞、脑梗死、血友病、I型糖尿病、甲亢、唇腭裂、布鲁氏杆菌病等，其发生的医药费用均列入大病保障范围。