南开大学是国内学科门类齐全的综合性、研究型大学之一。在长期的办学过程中，形成了文理并重、基础宽厚、突出应用与创新的办学特色。有专业学院22个，并设有研究生院、继续教育学院、现代远程教育学院，学科门类覆盖文、史、哲、经、管、法、理、工、农、医、教、艺等。学校积极构建和发展适应21世纪经济社会发展和人才培养需要的学科体系，有本科专业80个（其中国家级特色专业18个），硕士点231个，博士点172个，博士学位授权一级学科29个，博士后科研流动站28个。有一级学科国家重点学科6个（覆盖35个二级学科），二级学科国家重点学科9个，国家重点（培育）学科2个，一级学科天津市重点学科27个。有国家级重点实验室2个，国家工程研究中心1个，教育部重点实验室8个，科技部重点实验室1个，国家环保总局重点实验室1个，教育部工程中心3个，天津市重点实验室13个，天津市工程中心1个，国家基础学科人才培养和科学研究基地9个，大学生文化素质教育基地1个，国家外专局“111”创新引智基地5个，基金委创新群体4个，教育部创新团队（2013年度）3个，全国高校人文社会科学重点研究基地7个，“985工程”哲学社会科学创新基地7个，“985工程”科技创新平台4个。

南开大学拥有一支公能兼备、业务精湛、奋发有为、充满活力的师资队伍。在1986名专任教师中，有博士生导师616人、硕士生导师734人，教授714人、副教授805人。有两院院士（人事关系在本校）8人，发展中国家科学院院士5人，“973”和“863”计划首席专家15人次，教育部“长江学者奖励计划”特聘教授30人、讲座教授15人，国家级有突出贡献的专家11人，国务院学位委员会学科评议组成员12人，“马克思主义理论研究和建设工程”首席专家11人、主要成员29人，国家“百千万人才工程”入选者18人，“国家杰出青年科学基金”获得者34人，国家“千人计划”入选者9人，国家“青年千人计划”入选者4人，国家“特支计划”领军人才4人、青年拔尖人才4人，教育部“跨世纪人才基金”获得者21人，教育部“高校青年教师奖”获得者9人，教育部“教学名师奖”获得者8人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者176人，天津市“131”创新人才培养工程第一层次人选37人。