但并不是所有的劳动争议仲裁案件都公开进行，一些特殊案件如公开进行，反而可能会不利于对当事人权益的保护，带来消极的社会影响，甚至给国家利益、社会利益造成巨大损失。因此，本条规定双方当事人协议不公开，或者劳动争议涉及国家秘密、商业秘密和个人隐私的，不进行公开仲裁。

　　根据保守国家秘密法第二条的规定，国家秘密是关系国家的安全和利益，依照法定程序确定，在一定时间内只限一定范围的人员知悉的事项。其中第八条又对国家秘密所包含的事项作出了具体规定：国家秘密包括符合本法第二条规定的下列秘密事项：(一)国家事务的重大决策中的秘密事项;(二)国防建设和武装力量活动中的秘密事项;(三)外交和外事活动中的秘密事项以及对外承担保密义务的事项;(四)国民经济和社会发展中的秘密事项;(五)科学技术中的秘密事项;(六)维护国家安全活动和追查刑事犯罪中的秘密事项;(七)其他经国家保密工作部门确定应当保守的国家秘密事项。不符合本法第二条规定的，不属于国家秘密。政党的秘密事项中符合本法第二条规定的，属于国家秘密。国家秘密的密级分为绝密、机密、秘密三级。绝密是最重要的国家秘密，泄露会使国家的安全和利益遭受特别严重的损害;机密是重要的国家秘密，泄露会使国家的安全和利益遭受严重的损害;秘密是一般的国家秘密，泄露会使国家的安全和利益遭受损害。所以，为避免公开仲裁造成国家秘密泄露，给国家安全和利益造成损失，涉及国家秘密的案件不进行公开仲裁。

　　商业秘密是指构成一个企业竞争优势的任何不为他人所知悉的商业信息。除持有人以外的任何人未经许可使用这些信息都将被认为是一种失去商业信誉的侵权行为。我国反不正当竞争法第十条中规定：本条所称的商业秘密，是指不为公众所知悉、能为权利人带来经济利益、具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。商业秘密具有以下四个基本特征：(1)秘密性。商业秘密首先必须是处于秘密状态的信息，不可能从公开的渠道所获悉。即不为所有者或所有者允许知悉范围以外的其他人所知悉，不为同行业或者该信息应用领域的人所普遍知悉。(2)实用性。商业秘密必须是一种现在或者将来能够应用于生产经营或者对生产经营有用的具体的技术方案和经营策略。商业秘密与其他理论成果的根本区别就在于商业秘密具有现实或潜在的实用价值。不能直接或间接使用于生产经营活动的信息，不具有实用性，不属于商业秘密。(3)保密性。保密性，是指权利人采取保密措施，通过合理的保密手段，明示其保密意图。(4)价值性。价值性是指该商业秘密自身所蕴含的经济价值和市场竞争价值，并能实现权利人追求利益的目的。因此，如果公开仲裁，造成商业秘密泄露，会对该企业造成经济损失，降低其市场竞争力。经当事人提出不公开开庭的申请，对涉及商业秘密的案件不进行公开仲裁。