拥有3个国家级科研平台，其中，国家工程研究中心2个（中药固体制剂制造技术国家工程研究中心、中蒙药丸剂关键技术及工艺国家地方联合工程研究中心）、国家企业重点实验室1个（创新药物与高效节能降耗制药设备国家重点实验室）；有教育部重点实验室等30个省部级科研平台。近5年，共承担省部级以上项目581项，年均科研经费6711.37万元；获得国家发明专利授权56项、计算机软件著作权13项；有27项成果获省部级以上奖励，其中国家科技进步二等奖2项、省级科技进步一等奖2项。

学校始终坚持以推动中医药事业进步为使命，在针灸推拿、中药药剂等学科领域形成了较为突出的优势。原始创新成果——“热敏灸”理论和技术，成为国家行业建设标准并在上海世博会上向全球推广，开创了“北看天津针、南看江西灸”的格局。2015年，“热敏灸技术的创立及推广应用”获国家科技进步二等奖，填补了江西医学领域的空白。学校研发的中药制药系列关键技术和设备被100多家企业采用，产生了良好的经济社会效益。

学校始终坚持以服务地方经济发展为己任，产学研结合办学特色鲜明，服务经济建设成效显著。学校创建并发展了品牌价值106亿元的国家级高新技术企业——江中（制药）集团；累计为全国企业提供技术服务200余项，研发中药及相关产品70余个，先后有16个产品实现了单品种年销售额超亿元。学校依靠校办企业在全省高校中率先建设了新校园。近年来，相继与汇仁、济民可信、天齐堂、贵州益佰等大型中药生产企业建立了合作关系。2012－2015年，连续4年获批建设4个省级协同创新中心。

经过57年的建设与发展，学校的教育教学水平大幅提高，科学研究成果丰硕，各项事业实现跨越式发展，已成为以中医药为主体、多学科协调发展、产学研结合特色鲜明的高等中医药院校。