学校现设有人文社科学部、理工学部和医学部，拥有12个学科门类的119个本科专业，2个国家重点学科，1个国家重点（培育）学科，8个学术类博士学位授权一级学科，45个学术类硕士学位授权一级学科，1种博士专业学位授权和18种硕士专业学位授权，11个博士后科研流动站。学校设有5所附属医院，共有9个国家临床重点专科。学校化学、临床医学、农业科学（食品科学与工程为主）、工程学4个学科进入美国ESI排名前1%。1篇博士论文入选全国优秀博士学位论文，实现了江西省“全国百篇优博”零的突破。在全国第三轮一级学科整体水平评估中，食品科学与工程学科位列全国同类学科第4名。

学校是教育部普通高校本科教学工作水平评估优秀高校，具备扎实的办学基础。现有1个国家级教学团队，1门国家级双语教学示范课程，7门在线开放课程，2门国家级精品课程，6门国家级精品资源共享和视频公开课，3个国家级专业综合改革试点项目，9种“十二五”国家级规划教材，9个国家级特色专业，2个国家级虚拟仿真实验教学中心，5个国家实验教学示范中心，2个国家级大学生校外实践教育基地，4个国家级工程实践教育中心，14个国家级卓越人才教育培养计划专业。学校是教育部中国教育和科研计算机网（CERNET）江西主节点单位，是江西唯一一所参与中国下一代互联网示范工程CNGI建设的高校。《南昌大学学报》分文、理、医、工科版，其中文、理科版为中文核心期刊，医、工科版为科技核心期刊。

学校现有1个国家重点实验室，1个国家工程技术研究中心，1个教育部人文社会科学重点研究基地，2个教育部重点实验室，3个教育部工程研究中心，9个江西省协同创新中心。2015年，学校获批国家自然科学基金项目199项（位列全国申报单位第30名）；国家社会科学基金22项（位列全国高校第36名），其中国家社科基金重大项目2项，国家艺术基金项目1项。

学校协同创新能力不断增强，取得了一批原创性、标志性、有特色的科研成果。其中，硅衬底高光效GaN基蓝色发光二极管项目摘得2015年度唯一国家技术发明一等奖，这是自国家科学技术奖设立以来，首次由地方高校获得的一等奖，正助推江西打造“南昌光谷”。学校还与政府、企事业单位开展全方位、多层次的合作，促进科技成果转化，推进政产学研用紧密结合。

学校重视国际化办学，先后与30多个国家（地区）的90余所高校、科研机构建立了稳定的交流与合作关系。在法国普瓦提埃大学和印尼哈山努丁大学建有孔子学院和孔子课堂。学校与加拿大农业与农业食品部合作共建食品科学与技术联合实验室。