S-400之前的S-300PMU2，其一个作战营组成如下：
1个54K6E2指挥控制中心；1部最大作用距离300公里的64N6E2双面无源相控阵搜索雷达、1部最大作用距离300公里的96L6E低空搜索雷达（也采用无源相控阵体制）、1部30N6E2无源相控阵火控雷达；4部5P85S发射车，配套最大射程200公里的48N6E2导弹，可以向下兼容S-300PMU1的48N6E导弹（最大射程150公里）、S-300PMU的5V55RUD导弹（最大射程92公里）。
S-400相对S-300PMU2的改进是：
一、指挥控制中心升级为55K6，人机交互性能更好；二、搜索雷达升级为91N6，最大作用距离增大至600公里；三、火控雷达升级为92N6，最大作用距离增大至400公里；四、导弹升级为48N6E3（即48N6DM），最大射程提高至250公里。
俄军目前已装备数个营S-400远程防空导弹，但除了上述改变外，俄方之前宣传的射程400公里的40N6导弹，以及可以"一筒四弹"的9M96导弹（最大射程40公里）和9M96D导弹（最大射程120公里）都未有纳入其中。
在S-400之外，金刚石-安泰公司已另外推出S-350防空导弹系统。该系统就是以一部X波段有源相控阵雷达为基础，使用9M96系列导弹承担中程防空任务。
与海上舰队防空不同，陆地上的要地防空讲求成线、成网覆盖，远程防空导弹与中程防空导弹组成一体化系统缺乏必要性、甚至会造成局部火力密度过高的浪费，仅需搭配近程防空系统保护昂贵的远程导弹系统。例如我国空军通常会为红旗9远程防空导弹搭配陆盾2000近防系统，增强红旗9单位对敌方巡航导弹、反辐射导弹、GPS制导炸弹的抗击能力。
所以S-400以后很可能也不会增加9M96系列导弹，中俄S-400交易的唯一变数在于，中国此次购买有无纳入40N6导弹。

现时S400防空导弹系统组成及性能。
传统超远程地空导弹缺乏意义
超远程防空导弹其实早已出现，S-300之前、1967年服役的S-200远超防空导弹（北约编号为SA-5）射程即达到400公里。美国方面，波马克B防空导弹的最大射程更是达到惊人的700公里，波马克B于1961年服役，到1972年就已全部退役。早期的超远程防空导弹主要用于拦截敌方的战略轰炸机，但随着巡航导弹的兴起，战略轰炸机在战争初期已不再需要突防轰炸，而改为在防区外发射巡航导弹，人们很快对这些"大而无当"的防空导弹失去兴趣。

美军波马克B导弹于1961年服役，当时射程已达到惊人的700公里。
超远程防空导弹的唯一战果是，2001年俄罗斯一架图154客机在黑海上空遭到乌克兰军队的S-200导弹误击。当时乌克兰正在举行防空演习，导弹阵地距事发地点达374公里，创下地空导弹的最远命中记录。
现在超远程防空导弹返潮的始作俑者是美国海军。得益于现代通信技术的进步，美国海军发展了名为CEC的多平台协同交战能力，安装有主动雷达导引头的远程舰空导弹可以利用预警机的数据，对约400公里外、还处于地平线下的敌方战术飞机进行拦击。目前，美军标准6超远程舰空导弹已进入低速生产阶段。
标准6导弹成功的另一个关键是，它直接继承标准2ER blk4导弹的动力系统，通过优化弹道等措施，将最大射程由240公里提升至370公里。标准6导弹仅重1.5吨，尺寸与标准2ER blk4几乎一致，可以直接装入MK41垂直发射系统使用。
俄罗斯的导弹小型化技术远逊于美国，现在最好的48N6E3导弹，重量接近2吨，射程仅250公里，还不及美国10多年前的标准2ER blk4。号称射程达到400公里的40N6导弹迟迟未能露面，很可能就是在小型化方面遇到困难，因为S-400系统同样采用5P85S发射车，40N6导弹的重量和尺寸要做到与48N6E3导弹相当，才能装得进现有的发射筒。