围绕区域经济社会发展需要，学校坚持“重点做大做强工科，积极发展特色学科，稳步发展应用理科和人文学科”，逐步形成结构优化、特色鲜明、契合地方经济发展需要的专业集群，以本科教育为主，兼有联合培养研究生和留学生教育，以全日制教育为主，兼有继续教育的多层次、开放型办学格局。现有19个教学院部——机械与汽车工程学院、计算机与信息工程学院、电子与电气工程学院、土木工程学院、建筑与城市规划学院、艺术设计学院、经济管理学院、电子商务学院、外国语学院、数学与统计学院、音乐学院、文法学院、生物与化学工程学院、张仲景国医国药学院、软件学院、师范学院、继续教育学院，以及体育教学部、政治理论教学部，49个本科专业。

围绕服务南阳先进装备制造、光电信息、电商及物流、“楚风汉韵”古建筑遗存保护、仲景品牌医药等支柱、新兴产业，分别打造机械设计制造及其自动化、材料成型及控制工程；软件工程、光电信息科学与工程；电子商务、物联网工程；历史建筑保护工程、城乡规划；中医学、中药学等一批核心专业集群，逐步形成产业群、专业群、人才链与南阳经济社会发展的紧密对接。目前拥有9个教育部、省教育厅“卓越计划”试点专业，16个省级重点学科、特色专业以及专业综合改革试点，10门国家级、省级精品课程以及精品资源共享课程。

学校坚持“高起点、分步走、双师型、可持续”的教师队伍建设指导思想，培养与引进相结合、专职与兼职相结合、理论教师与实践教师相结合、学校教师与企业工程师相结合，建设一支结构合理、素质优良的专业化教师队伍。现有专任教师1108人，其中教授、副教授560人，博士、硕士学位教师778人。拥有河南省优秀专家、省政府特殊津贴专家、省学术技术带头人、省教育厅学术技术带头人22人，建设有20个省、校级创新型科技团队和教学团队，设有“河南省博士后研发基地”，聘请多位两院院士、知名专家学者为兼职教授。

学校坚持“教学为重，教学与科研并举，以教学带动科研、以科研服务教学质量”的理念。鼓励教师将最新科研成果应用到教学实践，促进教学内容更新，形成科研与教学的良性互动。近3年立项科研项目412项，其中国家级6项、省部级208项；鉴定各级各类科研项目375项；地厅级以上科研成果获奖150项；承接横向课题51项；公开发表论文2600余篇；出版专著、译著16本，主参编教材100余部。主办的《南阳理工学院学报》国内外公开发行，影响力不断提高。