2006年6月14日，《国务院关于改革公务员工资制度的通知》出台。《通知》强调，要有效调控地区工资差距，逐步将地区工资差距控制在合理的范围内。这次改革还对基本工资结构做了调整：基础工资和工龄工资不再保留，级别工资权重有所加大。同时，公务员工资级别从原来的15级调整为27级。
历次大的公务员工资改革都有亮点和遗憾
对于历次改革，胡颖廉认为都各有值得肯定之处和些许遗憾：
1956年改革实现了从供给制到货币制的跨越。然而该制度中不区分具体项目，直到1985年“结构工资制”的改革调整才解决上述问题。
1985年改革剥离了企业工作人员的工资部分。但这次改革存在一些弊端，比如奖金原则上是给绩效较好的员工，实际执行中则是人人有份;过度强调职务对工资的决定作用，造成了高职位不当扩张的弊端。
1993年改革让机关工作人员与事业单位工作人员脱钩，同时明确要防止高定级别、高套职务工资等不良现象。但是，虽然这次改革制定了用于补偿机关工作人员在不同地区生活成本的地区津贴制度，却恰逢我国地方政府预算外资金急剧扩张，导致地区间和部门间的巨大工资差成为1993年工资改革的硬伤，也成为2006年改革启动的主因。
2006年改革在大幅提薪的同时，统一了公务员工资级别。但是在政策执行中仍然存在一些问题，如工资统发和激励机制等问题。胡颖廉举例，如工资统发中有相互依赖关系的部门太多，没有一个主体有最高的权威。还有，对一线执行人员设立相应的激励措施是很有必要的，但这又违反了2006年改革的要求。
