学校编辑出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报（社科版）》、《中华高血压杂志》和《心血管康复医学杂志》等，面向国内外公开发行。学校图书馆面积2.56万平方米，图书、资料288.6万册，是福建省医学图书中心馆。

学校坚持开放的办学理念，积极开拓国际化办学新途径，先后与日本长崎大学、山梨大学、奈良医科大学、奥地利维也纳医科大学、瑞典林奈大学、丹麦哥本哈根城市大学、香港大学、台北医学大学、阳明大学、台北健康护理大学等高校和科研院所开展了多层次、多角度的合作。学校是我省最早接受国家公派留学生和开展全英教学的高校之一，港澳台侨和留学生培养涵盖博士、硕士、学士，在校留学生、港澳台生达500多人。

办学近八十年来，学校为国家和地方共培养输送了6万多名医学人才。校友中不乏杰出人才，其中有院士、专家、教授，许多校友都已成为医药卫生战线的领军人物。我校培养的学生以理论功底扎实，实践动手能力强著称，受到用人单位的广泛欢迎。近年来就业率始终保持在97%以上。此外，我校临床、口腔、护理等各专业学生在历年国家执业医师（护师）资格考试和英语四、六级考试等国考的通过率均远高于全省和全国平均水平，多年来参加全国高等医学院校大学生临床技能比赛成绩名列前茅。学校近年获大学生创新创业训练计划项目国家级150多项、省级近400项。

目前，学校正在努力成为福建医药卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗预防保健中心，成为一所高水平的教学研究型医科大学，力争在人才培养、科学研究、医疗卫生服务、文化传承创新等方面做出更大的贡献跨入国内同类高校先进行列。