| 北京协和医学院历年排名表 | |||||
| 年度 | 全国排名 | 省内排名 | 分类 | 分类排名 | 总分 |
| 2018 | 56 | 10 | 医科 | 1 | 64.41 |
| 2017 | 57 | 10 | 医科 | 1 | 64.09 |
| 2016 | 45 | 10 | 医科 | 1 | 66.03 |
| 2015 | 38 | 8 | 医科 | 1 | 66.80 |
| 2014 | 31 | 7 | 医科 | 1 | 67.58 |
| 2013 | 36 | 8 | 医科 | 1 | 65.33 |
通过上述北京协和医学院排名走势图可以看出，相对于2017年，北京协和医学院在全国排名中下降了1名；在北京省内排名保持不变；在医科类院校中排名保持不变。
四、北京协和医学院在全国的排名位次
在2018年全国高校排行榜中，和北京协和医学院排名比较接近的大学有上海大学和西北农林科技大学，不想就读北京协和医学院的同学，可以考虑下这两个学校。另外排名和北京协和医学院比较接近的大学还有：
| 名次 | 学校名称 | 总分 | 星级排名 | 类型 | 地区 |
| 52 | 华东理工大学 | 64.64 | 4星级 | 理工 | 上海 |
| 54 | 南京航空航天大学 | 64.50 | 4星级 | 理工 | 江苏 |
| 55 | 上海大学 | 64.42 | 4星级 | 综合 | 上海 |
| 56 | 北京协和医学院 | 64.41 | 6星级 | 医科 | 北京 |
| 57 | 西北农林科技大学 | 64.34 | 5星级 | 农林 | 陕西 |
| 58 | 苏州大学 | 64.21 | 4星级 | 综合 | 江苏 |
| 59 | 北京邮电大学 | 64.01 | 5星级 | 理工 | 北京 |
| 61 | 上海财经大学 | 63.83 | 6星级 | 财经 | 上海 |
