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3 图书馆——“协和三宝”之一
学校图书馆曾被誉为“亚洲第一”的医学图书馆，是我国历史悠久，藏书最为丰富的医学专业图书馆。协和自建校以来就非常重视图书馆建设，图书馆的馆藏特点有：
1）馆藏书刊多为外文原版，以生物医学为主；
2）收藏了一批难得的特藏书，比如西洋医学史专著和外国著名医学家传记，各种疾病的史料，部分珍贵的中医古籍，各种经典著作（有权威的大型教科书及有价值的图谱）等；
3）集中各类工具书，建成工具书阅览室
目前学校图书馆是国务院批准的国家级中心图书馆和国家科技图书文献中心医学分中心，也是联合国世界卫生组织卫生与生物医学信息合作中心，目前藏书51.2万册，电子图书1.5万册，期刊5000余种。按照数字图书馆发展方向，我校进行协和特色馆藏资源数字化，整合网上资源，自建“中国生物医学文献数据库”、“北京协和医学院研究生学位论文库”、“1983－2000年全国外文生物医学期刊馆藏联合目录数据库（网络版）”、“全国高等院校医药图书馆预订外文期刊联合目录数据库”、“医科院图书馆数字资源整合平台”、“突发公共卫生事件每日科技快讯信息服务平台”、“NSTL艾滋病预防与控制热点门户”等数据库和平台。其拥有的中国医学文献分析和检索系统向全国提供医学信息，并在全国建立起医学信息网，为教学、科研和医疗工作提供了宝贵的信息资源。
