仔细观察黑子可以发现，一个发展成熟的黑子是由中心颜色暗黑的部分和其周围暗黑的部分组成。前者是黑子的本影，后者为黑子的半影。黑子是太阳光球上的低温区，本影区的绝对温度在4000℃左右，半影则为5400℃。所以，黑子其实并不黑，只是因为它的温度比光球低，才在明亮的光球背景衬托下显得黑。导致黑子温度低的直接原因则是因为它自身具有强磁场，磁场强度约在1000高斯~4000高斯之间，比地球上的磁场强度高上一万倍。强磁场能够抑制太阳内部能量通过对流的方式向外传递。所以，当强磁场浮现到太阳表面时，该区域的背景温度缓慢地从5700℃降到4000℃左右，使该区域以暗点形式出现，即黑子产生。