应纳税额=(个人当月取得年终奖-个人当月工资、薪金所得与费用扣除额的差额)×适用税率-速算扣除数。

例2：刘某当月工资、薪金所得低于2000元(只有1400元)，2008年1月13日，该单位再向刘某发放年终奖3000元，因此，应将年终一次性奖金减除当月工资与费用扣除额2000元之间的差额后，计算缴纳个人所得税。据此，刘某在获得这笔年终奖时，应缴纳个人所得税120元。计算过程为：

应纳税所得额为3000-(2000-1400)=2400(元)

2400÷12=200元，适用税率为5%，速算扣除数为0;

应纳税额为2400×5%=120(元)

三、年终奖除以12低于2000也要纳税

特别需要强调的是，全年一次性奖金除以12后的余额，低于法定费用扣除额2000元也应该纳税。

因为纳税人的费用扣除额在工资中已扣除，用全年奖金除以12，主要是为确定适用税率和速算扣除数，不能作为判断是否纳税的依据。

例3：高某全年一次性奖金为18000元，用全年奖金除以12后为1500元，虽然这低于法定费用扣除额2000元，但也应按相应税率缴纳税款1775元。

18000÷12=1500元，适用税率为10%，速算扣除数为25

应纳税额为18000×10%-25=1775(元)

2009年8月31日，国家税务总局公布了“关于明确个人所得税若干政策执行问题的通知”。今后，单位在实行“双薪制”(单位为雇员多发放一个月工资)后，“双薪”应全额计算缴纳个人所得税的方法停止执行。

通知指出，近期部分地区反映个人所得税若干政策执行口径不够明确，为公平税负，根据相关规定，《国家税务总局关于个人所得税若干政策问题的批复》第一条，有关“双薪制”的计税方法停止执行。

原办法规定，国家机关、事业单位、企业和其他单位在实行“双薪制”后，个人因此而取得的“双薪”，应单独作为一个月的工资、薪金所得计征个人所得税。对上述“双薪”所得原则上不再扣除费用(起征点2000元)，应全额作为应纳税所得额按适用税率计算纳税(即第12个月工资和第13个月工资相加后再扣除起征点费用)。

四、单位发不含税年终奖个人所得税的计算

根据《国家税务总局关于纳税人取得不含税全年一次性奖金收入计征个人所得税问题的批复》(国税函〔2005〕715号)规定，对于年终奖个人所得税由单位负担的，如果个人当月工资薪金所得高于(或等于)规定费用扣除额的，其个人所得税的计算公式如下：