学校着力优化科研管理机制，不断增强科技创新实力。拥有血液病国家中医临床研究基地，有国家中医药管理局重点研究室3个、国家中医药科研重点实验室10个，浙江省重点实验室3个，浙江省公共科技条件平台2个，浙江省重点科技创新团队3支。近五年承担国家自然科学基金、国家“973”计划等国家级项目116项。近年来，获国家科技进步二等奖2项，国家技术发明二等奖1项，浙江省科学技术一等奖4项。先后与中国军事医学科学院以及丽水市、海宁市、衢州市、磐安县、余杭区、拱墅区、桐庐县等市县（区）开展了产学研战略合作，主动服务区域经济社会发展。办有《浙江中医药大学学报》、《浙江临床医学》2种学术期刊，其中《学报》是全国对外发行最早的中医学术刊物之一，在20多个国家和地区发行，被美国《化学文摘》、波兰《哥白尼索引》等国际著名检索系统收录。

学校重视扩大国际交流与合作，已与美国、德国、日本等26个国家与地区的58个教育、科研、医疗单位建立了合作关系，招收了52个国家与地区的国（境）外学生，先后聘请了39位外国专家学者为客座教授。

学校的建设与发展得到了习近平、张德江、李鹏、李岚清等党和国家领导人的关心和重视，以及社会各界的广泛关注与肯定。

目前，学校正以党的十八大精神为指引，沿着科学发展的道路，立足浙江、辐射全国、面向世界，齐心协力、开拓进取，为建设特色鲜明的高水平中医药大学而努力！