教学改革近年来，学校按照全面深化综合改革、注重内涵发展的要求，多措并举，积极推进教育教学改革。进一步调整优化专业结构，逐步构建了以农科为优势，农、工、经、管、理、文、法、教育多学科相互渗透、相互支撑、协调发展的学科专业框架;先后两次修订本科专业人才培养方案，2008年，以“加强基础、通专结合、强化实践”为重点，构建复合型、应用型人才培养模式，2010年，强调通专结合、分类培养，强化专业和实践教学，构建多样化的人才培养模式和体系;形成国家、省、学校三个层面的三级“质量工程”体系，共获准立项质量工程项目国家级52项、省级200项、校级81项;建设了课程开发系统、自主学习中心、实验教学中心、教学科研基地以及教学管理五大教学平台;2001年至今，共立项资助教改项目近261项;先后获国家级教学成果二等奖1项、优秀奖1项，省级教学成果特等奖1项、一等奖11项、二等奖32项;先后拥有了国家级教学名师、国家级精品课程、国家级实验教学示范中心、国家级人才培养模式创新实验区、国家级特色专业建设点;2005-2015年，连续11年评为云南省高校毕业生就业考评优秀，入选2011-2012年度全国毕业生就业50所典型经验高校，被国务院授予“全国就业先进工作单位”荣誉称号。

科学研究学校先后承担联合国全球环境基金、国家973计划、863计划、科技支撑计划、公益性行业科研专项、国务院综改办、国家基金重点项目等各级各类项目3000多项，科研经费达11.7亿元，获联合国粮农组织(FAO)科学研究一等奖、国际农业研究(CGIAR)杰出科学奖、国家技术发明二等奖、何梁何利科学技术进步奖、云南省科技进步特等奖等国际、国家及省部级奖励370余项，审定登记滇撒猪配套系、龙陵黄山羊、武定乌骨鸡、水稻、玉米、甘蔗、蔬菜、花卉、药用植物、牧草等动植物新品种(系)150余个。同时，学校立足云南生物资源优势，围绕省委省政府重大战略目标和“三农”发展需求，致力于重大科学问题理论创新、产业关键技术研发、产学研政企商相结合与农科教一体化的社会服务体系机制创新，为高原特色农业产业发展提供人才科技和智力支撑。其中，李铮友教授等率先在国内实现了杂交粳稻“三系”配套，获全国科学大会奖，创造了杂交粳稻单产1108.55千克的世界纪录;曾养志教授等潜心研究西双版纳微型猪近交系35年，繁育28世代，近交系数达99.96%，居国际领先水平;朱有勇院士团队的研究论文在《Nature》上作为封面文章全文发表，创建的作物多样性优化种植技术、冬季马铃薯无公害超高产技术被省委省政府列为重大科技成果推广，累计推广应用2亿余亩;盛军教授团队研发的生物多酚代谢免疫调节技术、普洱茶精深加工技术、生态种植技术，及研发的普洱茶珍、多酚云烟、辣木系列产品，为一批龙头企业提供了重要技术支撑。