科学研究学校先后承担联合国全球环境基金、国家973计划、863计划、科技支撑计划、公益性行业科研专项、国务院综改办、国家基金重点项目等各级各类项目3000多项，科研经费达11.7亿元，获联合国粮农组织（FAO）科学研究一等奖、国际农业研究（CGIAR）杰出科学奖、国家技术发明二等奖、何梁何利科学技术进步奖、云南省科技进步特等奖等国际、国家及省部级奖励370余项。审定登记滇撒猪配套系、龙陵黄山羊、武定乌骨鸡、水稻、玉米、甘蔗、蔬菜、花卉、药用植物、牧草等动植物新品种（系）150余个。同时，学校立足云南生物资源优势，围绕省委省政府重大战略目标和“三农”发展需求，致力于重大科学问题理论创新、产业关键技术研发、产学研政企商相结合与农科教一体化的社会服务体系机制创新，为高原特色农业产业发展提供人才科技和智力支撑。其中，李铮友教授等率先在国内实现了杂交粳稻“三系”配套，获全国科学大会奖，创造了杂交粳稻单产1108.55千克的世界纪录；曾养志教授等潜心研究西双版纳微型猪近交系35年，繁育28世代，近交系数达99.96%，居国际领先水平；朱有勇院士团队的研究论文在《Nature》上作为封面文章全文发表，创建的作物多样性优化种植技术、冬季马铃薯无公害超高产技术被省委省政府列为重大科技成果推广，累计推广应用2亿余亩；盛军教授团队围绕云南特色生物资源开发与利用，在生物多酚代谢免疫调节技术、普洱茶和辣木精深加工技术等方面，为一批龙头企业提供了重要技术支撑。

社会服务学校坚持走中国特色科教兴农之路，高度重视科技成果转化和推广，大力推进校地、校企间深度合作，逐步形成以服务“三农”为主体，多项社会服务工作为支撑点的“一体多点”科技服务新格局，社会服务工作成绩显著。深入开展校地、校企合作，与昆明、普洱、文山、德宏、迪庆、大理等10余个州（市），与150多家龙头企业签订合作协议，建立了全方位、深层次、宽领域的合作关系；多年开展“3+3”校县联合行动，大力扶持当地发展优质、高产、高效现代农业；自2015年，开展姚安县前场镇木署村、南华县沙桥镇新华村“挂包帮、转走访”工作；发挥国家级新农村发展研究院，云南省高原特色农业产业研究院，云南农村干部学院，云南省食品安全管理学院，中国—东盟教育培训中心优势和作用，积极探索建立以大学为依托、农科教相结合、教科推一体化的科技服务新模式。学校连续七年被省委、省政府表彰为“年度社会扶贫先进集体”；2011年被省委、省政府表彰为“‘十一五’扶贫开发工作先进集体”“新三年兴边富民工程先进集体”“全省粮食生产先进单位”。