学校建设有3个校级研究所：民族文化与社会发展研究所、玉溪经济社会发展研究中心、玉溪师院大学生美育与素质拓展研究中心，其中民族文化与社会发展研究所与北京大学汉语语言学研究中心联合建设的“语音乐律实验室”已建成并投入使用。

学校积极开展科学研究，形成教学与科研的良性互动，不断提升服务地方经济社会发展能力。“十二五”以来，学校承担国内外科研项目321项，其中,纵向项目240项，横向项目81项。项目经费共2073万元，其中纵向项目经费1041.8万元，横向项目经费1031.2万元。纵向项目中国家社科基金项目10项，国家艺术基金1项,国家自然科学基金项目4项；省部级项目55项，地厅级项目170项。教师出版个人学术专著或编辑出版教材等120部，发表论文1419篇，其中核心以上刊物发表论文409篇，有238篇论文被SCI、EI、ISTP和人大报刊复印资料收录。共有74项学术科研成果获省、市有关部门奖励。学校公开报刊有《玉溪师范学院学报》和《玉溪师范学院报》，与国内外高校、科研院所、企事业等多个单位建立了良好合作关系。

学校坚持国际化办学，先后与美国奥本大学、澳大利亚墨尔本大学、拉特罗布大学、韩国三育大学、泰国清莱皇家大学、呵叻皇家大学、华侨崇圣大学、蒙福学院、南邦学院，以及台湾东方设计学院、昆山大学、屏东商业学院等多所学校积极开展多种形式的联合办学，互派师生，进行学术文化交流。已建立国外实习基地21个，成立汉语言文化中心3个，并成为云南省华文教育基地和国家汉办汉语水平考试（HSK）考点。

学校全面推进素质教育，育人成效显著。学校现有大学生创新创业训练计划国家级立项项目13项。在近年全国大学生数学建模大赛中荣获全国一等奖1项，全国二等奖8项，省级一等奖7项，二等奖20项。全国文化艺术节中3个作品获得全国最高奖项群星奖，全国美展有15幅作品入选，全国大学生艺术展演中，全校共有39件作品获奖；2016年荣获“创青春”云南省大学生创业大赛参赛学校团体金奖，3件作品荣获2014“创青春”全国大学生创业大赛第九届“挑战杯”大学生创业计划竞赛铜奖；青年志愿者协会荣获第十届中国青年志愿者优秀组织奖，校团委荣获2013-2016年度全国优秀“西部计划”办公室。

学校建立了完整助学体系，并开办各类“贫困生能力培训项目”，确保每一名学生不因家庭经济贫困而失学，为学生的成长成才提供强有力的保障。