新疆医科大学厚博学院为2003年5月6日获准成立，并根据2004年2月5日 教育部教发函[2004]13 号文件正式批准，由新疆医科大学举办的一所按新机制、新模式运作，充分依托、发挥新疆医科大学综合办学优势，中西医并重，具有浓郁地域特色的本、专科层次的综合性高等医学院校。厚博学院现有教学管理科、学生管理科、财务管理办公室、综合办公室等4个职能科室，8名工作人员。 

新疆医科大学厚博学院现有鲤鱼山和克拉玛依两个校区，是国家教育部确认的独立学院。

新疆医科大学鲤鱼山校区占地300多亩，1期工程共投资1.5个亿，现建有1栋教学楼、1栋学生食堂，2栋学生公寓，总建筑面积达到8万多平方米。其中，形态学实验室、机能学实验室、计算机实验室、语音室、浴室、图书室、学生活动中心已陆续建成并投入使用，学习、生活设施日趋完善。2015年克拉玛依校区投入使用。克拉玛依校区占地2355亩。

申请举办厚博学院的新疆医科大学，是一所集教学、科研、医疗为一体的综合性医科大学，目前有18所学院、4个系。拥有临床医学、药学、公共卫生与预防医学等3个博士后流动站；内科学、劳动卫生与环境卫生学、药理学等3个博士学位授权点；37名博士生导师。另外，新疆医科大学拥有35个二级学科硕士学位授权点，315名硕士生导师。

新疆医科大学拥有5个省级重点学科，即，生物化学与分子生物学，药理学、内科学、外科学，劳动卫生与环境卫生学；包虫病实验室、新疆地方病分子生物学实验室等2个省级重点实验室。

新疆维吾尔医学专科学校，简称“新疆医专”，是全国唯一一所以继承、挖掘、提高和弘扬维吾尔医药学为宗旨，以培养维吾尔医医药高素质专业技术人才为目标的全日制普通专科学校。 学校占地总面积 66667平方米，建筑面积达19000平方米。学校用维吾尔语授课，开设 2个专业，26门课程，其中13种维医、药专业课程教材是由该校组织著名老专家编写而成，还开设有成人教育科。

新疆维吾尔医学专科学校是经国家教育部正式批准的，具有维吾尔医药学类、护理、医学检验技术和康复治疗技术专业大专学历培养资格的唯一一所高等学府，也是国家级维吾尔医药学非物质文化保护单位。学校现已成为一所教育思想先进、管理水平较高、教学条件完备、具有浓郁区域、地缘特点和维医学、维药学、护理、医学检验技术和康复治疗技术人才培养特色的实用性高职院校。