第二批录取学校包括一级达标校普高择校生，双十中学、集美中学中澳班，厦门一中、外国语学校中美班，全部面向全市招生。在符合各考试科目等级、综合素质评价毕业总评等方面的前提下，各校普高择校生及中澳、中美班录取的最低投档分数及全市最低位次如下：
| 学校名称 | 最低投档分数及全市最低位次 |
| 厦门一中 | 择校生最低投档分590分，最低位次为全市1793位；中美班最低投档分585分，最低位次为全市2330位。 |
| 厦门二中 | 择校生最低投档分557分，最低位次为全市5829位。 |
| 厦门六中 | 择校生最低投档分572分，最低位次为全市3952位。 |
| 外国语学校 | 择校生最低投档分588分，最低位次为全市1991位；中美班最低投档分584分，最低位次为全市2445位。 |
| 双十中学 | 择校生最低投档分589分，最低位次为全市1871位；中澳班最低投档分584分，最低位次为全市2443位。 |
| 科技中学 | 择校生最低投档分571分，最低位次为全市4114位。 |
| 湖滨中学 | 择校生最低投档分548分，最低位次为全市6842位。 |
| 松柏中学 | 择校生最低投档分553分，最低位次为全市6219位。 |
| 集美中学 | 择校生最低投档分559分，最低位次为全市5570位；中澳班最低投档分540分，最低位次为全市7699位。 |
| 厦门十中 | 择校生最低投档分536分，最低位次为全市8155位。 |
| 海沧实验中学 | 择校生最低投档分544分，最低位次为全市7246位。 |
| 同安一中 | 择校生最低投档分572分，最低位次为全市3956位。 |
| 翔安一中 | 择校生最低投档分529分，最低位次为全市8765位。 |
