科学研究学院现有心血管医学研究所等16个省级、院级研究机构。其中，作为四川省科技条件平台的省级重点实验室心肌电生理实验室、省重点学科传染与免疫研究室具有较高水平。近三年，学院获得厅局级以上科研课题253项，其中，国家级课题10项，获省级科技进步奖12项，省哲学社会科学奖1项，省教学成果奖8项，省高等教育学科优秀科研成果4项，国家专利授权8项；出版学术专著44部，发表论文2,919篇，其中核心期刊453篇，SCI收录论文19篇。2006年获得国家自然科学基金项目6项，首次获得省科技厅国际合作项目资助1项和“十一五”重大攻关项目1项，获得四川省科技进步奖6项（一等奖1项、二等奖1项、三等奖4项），取得建院以来省科技进步奖一等奖零的突破，科研的立项及获奖的数量、级别逐年提高。

学院主办有面向国内外公开发行并获得国际文献检索系统CODEN代码和国家科技期刊统计源的《泸州医学院学报》。2006年，经四川省新闻出版局批准，我国西部地区第一份医学与法学交叉渗透、相互结合的学术性季刊《医学与法学》杂志创刊发行。

医疗服务学院三个直属附属医院不断加强内涵建设，提高医疗、科研、教学水平，医疗技术水平和服务质量连上台阶，早在20世纪60年代，附属医院率先在四川省成功开展断肢再植手术；70年代末继华西医科大学之后在四川省第二家成功开展器官移植手术；2004年、2005年相继成功开展四川省首例连体婴儿分离术、心脏移植手术，是川、渝、滇、黔结合地区的医疗、教学、科研中心。

对外交流与合作近年来，学院加强了国内外交流与合作，与美国、日本、德国等13个国家和地区的医学教育、医疗卫生和科研机构建立了长期联系，并开展了国际合作研究项目，援外医疗工作成绩显著。学院聘请有中国科学院院士、著名医学遗传学家吴旻教授为名誉院长，中国工程院院士、著名口腔医学专家邱蔚六教授为客座教授，中国社科院学部委员、著名法学专家梁慧星教授为兼职教授。通过扩大与国内外高校的交流与合作，促进了学院教学、科研、医疗及管理水平的不断提高。

党的建设与思想政治工作学院坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，认真贯彻党的路线方针政策，加强了党的建设、思想政治工作和精神文明建设，进一步完善了基层党组织建设有关制度和工作机制，为学院的改革、建设和发展提供了有力的思想、政治和组织保证。学院党委进一步切实加强和改进了大学生思想政治工作，建立健全了规章制度，加大了学生政工干部队伍的培养力度，为进一步加强大学生思想政治教育提供了保证。学院以思想政治理论课为主渠道，以第二课堂教育活动为主要手段，加强了大学生思想道德与文化素质的培养和教育。学院组织开展了丰富多彩、生动多样的学生活动，取得了良好成效。通过加强党的建设和校园精神文明建设，学院校风、教风、学风良好，各级领导班子团结进取、开拓创新，广大教职医护员工勤奋工作，学生刻苦学习，学院各项工作呈现出协调发展的良好局面。