雅安校区环境优美，老校区有上百棵历史悠久的法国梧桐树，号称“百万大道”，新校区有一里长的“桂花大道”以及安静优雅的“老板山读书公园”和富有特色的“农牧场”。雅安校区拥有四川乃至全国先进的动物疾病检测仪器、动物疾病研究控制室、动物医院。

成都校区

四川农业大学成都校区位于成都市温江区，占地面积850余亩。其前身是1988年经四川省人民政府批准成立的四川农业大学水稻研究所。1990年12月，水稻研究所从雅安迁到温江。2005年，为适应经济社会发展需要，打造西南乃至全国具有重要影响的农业科技创新高端平台，学校决定以水稻研究所为基础，集中学校最具优势的学科，将位于都江堰市的小麦研究所、位于雅安校本部的玉米研究所、动物营养研究所、园林研究所等研究机构迁至温江，建立四川农业大学成都科学研究院。2008年“5.12”汶川大地震后，根据国家发改委等11部委批复的灾后重建规划，学校将都江堰分校灾后重建项目纳入温江实施异地重建。2010年7月，学校撤销成都科学研究院，成立四川农业大学成都校区。2010年10月10日，成都校区正式启用。

成都校区现有8个学院、10个研究所和1个研究中心，即农学院、资源环境学院、经济管理学院、风景园林学院、动物医学院、动物科技学院、林学院、园艺学院、水稻研究所、小麦研究所、玉米研究所、动物营养研究所、动物遗传育种研究所、预防兽医研究所、生态林业研究所、果蔬研究所、生态环境研究所、园林研究所和四川省农村发展研究中心。距成都校区25分钟车程的崇州市桤泉镇，一个占地2300余亩的现代农业研发基地正在建设之中。

都江堰校区

四川农业大学都江堰校区是四川农业大学的重要组成部分，位于国家优秀旅游城市——都江堰市，被誉为“花园式学校”。

目前，校区占地面积1661余亩，校园占地341余亩，教职工276人，专兼职教师170人，在校生5098人，研究生36人，现设城乡建设学院、旅游学院和商学院3个教学单位，9个党群行政管理部门和1个后勤服务公司和多个培训机构。校区现有土木工程和工程管理2个重点本科专业，12个普通本科专业；8个职教师范本科专业，5个普通专科专业；教授、副教授55人，讲师101人，博导、硕导12人。博士20人，硕士42人。师资队伍中有国家突出贡献的中青年专家1人，享受国务院政府特殊津贴高级专家3人，国家优秀教师1人、师德标兵1人，四川省学术技术带头人、后备人选2人。