与此同时，学校坚持协同创新，作为核心单位参与了京津冀高端制造共性关键技术协同创新中心，现代服务业协同创新中心、中国-东盟区域发展协同创新中心等各项工作。建设了现代设计与文化研究中心、美国研究中心、越南研究中心、中国高铁发展战略研究中心、性别平等与妇女发展事业研究培训基地。相关团队参与的两项高速列车车体设计在高铁建设中得到运用并获“中国创新设计红星奖”。与康奈尔大学联合成立了“科技与社会创新国际中心”。“歌德及其作品汉译研究”成功申报国家社科基金重大项目。研究发布的中国和世界高校国际化排行榜（URI）影响广泛。

学校不断加大服务社会的力度，与京沪高铁、中国南车、中国北车等国内知名企业开展全方位合作，与神华集团建立了实质性“战略联盟”关系，与西门子、卡特彼勒、罗克韦尔、成飞集团、中兴通讯、攀钢集团、九洲集团、成都第三人民医院、成都军区总医院，四川省政策研究室、四川省经济与信息化委员会，成都铁路局，以及唐山、常州、盐城、成都、绵阳、乐山、宜宾、资阳、攀枝花、内江等政府、企事业单位和地区开展了全面战略合作。建有国家级大学科技园（科技部认定的“国家级科技企业孵化器”）、国家技术转移中心；是国家高速列车产业技术创新战略联盟、国家重载机车车辆产业技术创新战略联盟、四川省北斗卫星导航产业联盟、四川省航空发动机产业联盟等行业产业联盟成员单位。近年来，学校联合在川的轨道交通行业单位共同组建了“四川轨道交通产业技术研究院”，成为四川省首批试点的产业技术研究院之一；创建了第一个汽车零部件及注塑机产业价值链协同平台；规划了四川省成都市、遂宁市国家物流示范城市等30余个物流产业园区，主持制定了《四川省建筑抗震鉴定与加固技术规程》、《成都国家公路运输枢纽总体规划》；制定了成都、广州、深圳、昆明等城市地铁的相关标准与规范，研制的PSCADA系统广泛应用于广州、成都地铁。科技产业集团连续十一年获得四川省校产综合评比一等奖；校办产业在教育部2012年年度考评中首次获评A级，进入全国八强。先后成立了纵贯南北，覆盖京津、“环渤海”、“长三角”和“珠三角”地区的北京、唐山、常州、上海、深圳五大研究院；建有金融大数据研究院、中国公私合作（PPP）研究院；在国家级天府新区建设了天府新区研究院。建设有西南交通大学附属成都市第三人民医院。

学校主动对接国家战略，作为副组长单位继续对口支援西藏大学，在推动西藏大学工科和工学院实现从无到有、从小到大、从单一学科到多学科的跨越式发展基础上，在全国率先采用“1+2+1”联合培养模式，同藏大一起联合培养“信得过、留得住、上手快、后劲足”的高水平应用型工程技术人才；与藏大合作建设的“西藏大学工程应用技术学院”正式挂牌，全国首创的“1+2+1”联合培养模式并示范推广，并与西藏自治区人民政府共建该学院；援藏工作的做法和建议得到了俞正声同志亲笔批示，这是国家领导人对学校援藏工作的再次高度肯定。2013年、2016年，学校还与《光明日报》共同成功举办了两届“中国高铁走出去战略高峰论坛”，受到海内外社会各界高度关注。