若按校友会版排行榜看，齐鲁医药学院2018年全国排名第98位；2017年全国排名第119位；2016年全国排名第110位；2017年全国排名第100位；全国排名第40位；2013年全国排名第41位。以下是齐鲁医药学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 星级 | 所在地 | 类型 | 办学类型 | 办学层次 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2018 | 98 | 齐鲁医药学院 | 2 | 山东 | 应用型 | 区域高水平民办大学 | |
| 2017 | 119 | 齐鲁医药学院 | 1 | 山东 | 医药 | 应用型 | 区域知名民办大学 |
| 2016 | 110 | 齐鲁医药学院 | 1 | 山东 | 应用型 | 区域知名民办大学 | |
| 2015 | 100 | 山东万杰医学院 | 1 | 山东 | 医药 | 应用型 | 区域知名民办大学 |
| 2014 | 40 | 山东万杰医学院 | 3 | 山东 | 应用型 | 中国知名民办大学 | |
| 2013 | 41 | 山东万杰医学院 | 山东 |
若按金平果版排行榜看，齐鲁医药学院2017年全国本科院校排名第743位；2016年全国本科院校排名第717位；2017年全国本科院校排名第666位。以下是齐鲁医药学院历年排名整理表：
