学校坚持特色制胜、争创一流，形成一批优势和特色学科专业。现有中医基础理论、中医医史文献、中医内科学3个国家重点学科，国家中医药管理局重点学科29个；国家临床重点专科9个，国家中医药管理局重点专科14个；有中医学、中药学、针灸推拿学和制药工程4个国家级特色专业，11个省级特色专业；建设3门国家级精品开放课程、33门省级精品课程。
学校注重科技创新驱动，打造一流科研平台，取得丰硕成果。现有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，设有1个国家教育部重点实验室、6个国家中医药管理局三级重点实验室，2个国家中医药管理局重点研究室、2个山东省重点实验室、3个山东省工程技术研究中心、1个山东省工程实验室，立项牵头山东省高等学校协同创新中心。“十二五”期间，共承担厅局级以上科研课题780项，其中国家级项目102项，连续三年获得山东省科技进步一等奖。建校以来，获国家级和省部级一等奖奖励的科研成果共计22项。拥有国家中医临床研究基地、国家重大新药创制平台（山东）中药单元平台。
在建设一流中医药大学的征程上，学校始终坚持社会主义办学方向，牢固树立创新、协调、绿色、开放、共享的发展理念，以立德树人为根本，以创新驱动发展、服务地方经济社会为导向，坚持人才培养的中心地位和中医药学科专业的核心地位，突出中医药特色优势，注重文化传承创新，强化内涵建设，深化教学改革，不断提高人才培养质量，全面提升学校的综合实力和办学水平，努力培养德智体美全面发展的中国特色社会主义合格建设者和可靠接班人。
经过高考的洗礼，欢迎山东中医药大学新生们步入了向往已久的大学殿堂。然而大学不是天堂，也不是娱乐场，而是步入职业前充电加油的场所，大学也会与想象中的不一样，原先升学的愿望已实现，新的目标尚未找到，难免陷入暂时的迷茫，同时也感觉到大学与中学有着截然不同的生活、学习方式，需要尽快转变角色，适应大学生活。为了让各位学子快速融入大学生活中去，入学全功率，送给山东中医药大学所有新生。
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