学校不断提升科研水平。现有自治区级重点实验室4个。建有内蒙古包头医学院沙棘属药用植物资源保护与开发利用院士专家工作站、包头市包头医学院沙棘属蒙药资源保护与开发利用院士专家工作站、包头医学院第一附属医院转化医学与个体化医学院士专家工作站、包头医学院第一附属医院介入治疗院士专家工作站、“低氧预适应转化医学”北京市重点实验室包头医学院分室。内蒙古自治区基因诊断研究所、应用解剖研究所、消化病研究所、高血压病研究所和内蒙古全科医学培训中心、内蒙古学校卫生人员培养基地等研究培训机构设在我校。

学校有非直属附属医院13所、临床教学实习医院32所、自治区全科医学教育培训基地15个、公共卫生教学基地39个、药学专业教学基地12个、法医学专业教学基地13个。

包头医学院积极开展国内外交流与合作。与北京大学医学部、首都医科大学、山东大学医学院、西安交通大学医学院等国内多所知名院校建立密切合作关系；与澳大利亚拉筹伯大学合作办学，与英国设菲尔德大学、韩国极东大学、英国北方总院、巴恩思利医院、设菲尔德大学儿童医院建立友好协作医院，聘请部分国内外知名人士为名誉教授。

学校面向全国15个省、市、自治区招生。现有各类在校生1.5万余人。经过五十多年的建设与发展，学校先后培养输送5万多名德才兼备的合格医学人才，为国家和自治区经济发展、社会进步和医药卫生事业做出了重要贡献。

包头医学院秉承“团结、敬业、求实、创新”的校训，弘扬“艰苦奋斗、自强不息、勤俭奉献”的精神，努力建设成为在国内有一定影响、在少数民族边疆地区同类院校中处于先进水平、办学特色鲜明的医学院校。

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