建校以来，南外仙林分校始终怀着“办对人民负责的学校”的教育情怀，以“顺其自然”为校训，以“民主、进取、开放、创新”为校风、“自觉、自主、自信”为学风，全面推行素质教育、实行教育改革，坚持“四项基本教育原则”，在办学体制、课程标准、课程计划、德育工作（理想教育特色）、课堂教学、学科特色（外语、心理、科技）、班级及中层管理体制、学生多元化评价方式、教师评价和分配制度、多样化国际化办学诸环节进行了大规模，全方位深入而持久的改革，大大提升了学校的教育力（1.资金投入与硬件设施 2.教师水平与学生素质 3.课程计划与课程标准4.教育方式与教育科研 5.办学思想与学校文化）水平和教育质量，促进了教育关系（1.学校体制和办学环境 2.机构设置和管理方式 3.评价制度和分配制度）的良性发展，逐步形成了整体融合的机制，走出了一条“有个性、有特色、轻负担、高质量”的创新办学之路。

  南外仙林分校外语教学践行“情景——结构——交际”的教学模式，实行小班上课、外教执教、中外教材并用和听说领先，读写结合，高频率、大容量、快节奏的先进外语教学方式，极大地提高了学生的外语素养。南外仙林分校在遵从“顺其自然”校训基础上，充分尊重学生的个性发展，营造民主、进取、开放、创新的教育教学氛围，这是南外仙林人引以为自豪的精髓。开展丰富多彩的活动，提供各种各样的机会，让学生的各种能力得到锻炼，这是南外仙林校园特有的风景线。课堂教学改革、外语节、艺术节、读书节、科技节、体育节、远足活动、音乐会、学生会干部竞选、才艺展示、演讲会、辩论会等等，使学生们在学中“玩”，在“玩”中学，最大程度地实现了知和行的统一。学校制定有自己的《理想教育纲要》，创建出 “目标理想，三力合一”、“目标卡”、“理想教育八条途径”和“生涯规划”等多种有效教育方法；学校高度重视课堂教学改革，探索出“学案引领、板块推进”的教学模式；学校在全国率先取消了班主任负责制，实行“班级教育小组制度”，充分调动全体教师教书育人的积极性，调动学生和家长（各学部还另设家委会）参与班级建设的积极性，大大深化了班级管理体制改革，优化了学生素质；学校废除了 “三好”学生评比制度，对学生实行六个维度二十个项目的多元化评价体系；学校还制定了《南外仙林分校办学法典》，受到教育部的高度评价。

  南外仙林分校一直秉承和推行特色教学、差异发展的办学思路。学校以国内和国际课程标准为重要教育内容，以迈向教育国际化为追求，把外语特色看作是学校的核心竞争力。学校实行国际化、多元化办学，为毕业生搭建了宽阔的升学“立交桥”。普通高中实行小班化教学、个性化辅导，综合推进率高，学生出路多样化、多通道。同时，南外仙林分校加快办学国际化步伐，2004年起组建国际高中部，先后创办了中澳VCE班、中新班、中德班、中美GAC&ACT班、中美班。拥有健全完善的教学管理班子和优秀的中外教师队伍，实行外方教学、中外合璧式管理。