学校教学质量非凡，高考成绩保持高位稳定提升，年年超额完成上级部门下达的各项高线奋斗目标。自2004年南京市教育局开始对全市高中高考成绩和办学绩效进行评估以来，三中至今已连续十四年蝉联南京市“高中教学质量评估综合奖”和“高考质量一等奖”（最高奖），2010至2017年因优异的高考成绩，学校同时蝉联南京市第一至第八届校长质量管理奖，受到上级领导的表彰和广大家长的肯定。学校多次在南京市教学工作表彰大会上做经验介绍，是全市少数获此殊荣的高中。2017年我校高考再创辉煌，519人参加高考，本一上线263人，本二及以上上线514人，本一达线率超50%，本二达线率超99%。

 学校师资队伍雄厚，拥有名校长、特级教师、正教授级教师、市区学科带头人、市区优秀青年教师共118人，博士、硕士研究生102人，中学高级教师196人。学校注重教师继续教育，每年都安排教师参加国内外各类培训。教学业务精湛、管理能力突出、工作精力充沛的高素质的教师群体，是学校取得突出办学成绩的重要支撑。

学校坚持推进素质教育，重视学生全面发展。每学期都开设二十多门校本课程。美术、管乐、女排、游泳、业余无线电台、航海模型等特色项目已名扬海内外。美术、音乐类毕业生本科录取率达95%以上，一大批同学被清华大学、中央美院、中国美院、上海交大等名校录取。校女排6次代表中国参加世界比赛，获得5次冠军1次亚军。校游泳队多次代表江苏参加全国中学生运动会，获得多项团体与个人冠军。三中还有南京市中学生管乐一团，曾赴荷兰参加世界比赛获得金奖。学校还是省航海模型运动基地校，多次获得全国比赛团体与个人冠军。三中学生无线电台成立二十多年，是江苏省无线电课程教育基地，先后培养了200多人次在全国青少年无线电锦标赛中荣获奖牌。2007年8月26日，成功实现了中国学生与国际空间站宇航员的“天地对话”。

，学校创设了国际部，先后与美国佛蒙特州国际学校、利弗莫尔国际学校以及美达菲学校合作，全面引进美国高中课程。三中国际部凭借小班化纯英语教学，完善的教育服务与管理系统，成为南京地区一所品质纯正的美国高中。2017年，首届22名毕业生收到80余份来自美、加以及澳洲名校的录取通知书，总计获得48万美元的奖学金。2018届毕业生也全部收到包括昆士兰大学、伦敦艺术大学在内的美、加、英、澳著名高校的录取通知。国际部的成立更加拓宽了南京三中的办学途径，提升了学校的办学档次。

目前，南京三中的教学质量和全面推进素质教育都走在市、区前列，得到了上级领导和社会各界的充分肯定。