吉林医药学院学生公寓现有学生公寓四座，分别为A、B、C、D座，全部按上级主管部门标准化学生公寓的建设要求建设。每座楼内有420个标准四人间，可入住1680人。每间宿舍内有电源、网线、插座各四个，电话线插座一个，有凉衣阳台。宿舍配备多功能组合床，上层是床铺，下面是写字台、书架、衣柜、杂物柜及电脑主机箱等。为照顾家庭经济困难的学生，公寓内还设置了经济间，房间同标准间一样，只是使用了上下铺的双层床，住6人。

公寓楼设计为U字型，便于管理，安全度高；医学教|育网搜集整理楼外侧和院内均安装了数字监控系统；为保证用电安全，使用了智能用电控制设备，可自动阻断违章用电器具的使用。另外，公寓还设有洗衣房，使用国内一流洗涤设备免费为学生洗涤床单、被罩，并开展一些收费项目的服务。吉林医药学院学生公寓的条件与吉林省内以至全国高校相比都是一流的。近年来，教育厅、卫生厅、省党校、兄弟高校领导及各高校公寓管理部门的领导多次来公寓参观指导，给予了高度评价。