学科专业现设有临床医学院、基础医学院、特殊教育学院、口腔医学院、护理学院、人文与社会科学学院、药学院、中西医结合学院、公共卫生与管理学院、外国语与国际交流学院、葡萄酒学院、康复医学院、老年医学院、继续教育学院等14个院(系)。设有临床医学、临床医学(全科医学)，口腔医学、护理学、中医学、医学影像学、麻醉学、预防医学、生物技术、药学、信息管理与信息系统、信息管理与信息系统(卫生信息化方向，校企联合培养)、法学、英语、应用心理学、统计学、公共事业管理学、劳动与社会保障、医学检验、眼视光学、康复治疗学、市场营销、特殊教育、听力与言语康复学、生物制药、葡萄与葡萄酒工程等26个本科专业方向，其中，口腔医学、临床医学、护理学、生物技术等4个专业为国家特色专业建设点，医学影像学、药学、信息管理与信息系统、麻醉学等8个专业为省级特色专业。设有临床医学、基础医学、护理学等3个硕士学位授权一级学科，口腔临床医学、中西医结合临床等40个硕士学位授权二级学科，临床医学、口腔医学、公共卫生、应用心理、药学等5个硕士专业学位授权点。

现有神经生物学、呼吸病学、预防医学与卫生学、分子影像学、口腔临床医学、免疫学等6个“泰山学者”设岗学科，中西医结合临床、医学免疫学、口腔科学、临床营养支持中心(肝胆外科)、内科学、人体解剖与组织胚胎学、病理学与病理生理学、影像医学与核医学等8个省部级重点学科，临床营养与代谢、肿瘤分子生物学实验室、医学生物技术等3个省级重点实验室，医学人文研究中心1个省级人文社科基地，天然药物、生殖免疫、中医证候研究、脑中风、耳科遗传病、神经精神药理、呼吸睡眠、分子影像学等8个省级医药卫生重点实验室，中药现代化与新剂型开发1个山东省中医药重点实验室。有病理学、组织学与胚胎学、儿科学等3门省级教学改革试点课程，组织学与胚胎学、病理学、生物化学、药理学、病理生理学、生理学、外科护理学、内科护理学、发育生物学、分子生物学、细胞生物学、遗传学、儿科学、诊断学、医学免疫学、人体发育学、妇产科学、局部解剖学、外科学、外科学总论、系统解剖学、分析化学、天然药物化学、无机化学、物理化学、有机化学、超声诊断学、核医学、医学影像检查技术学、医学影像诊断学、影像解剖学等31门省级精品课程，临床技能实训中心、口腔医学实验教学中心、医学基础实验教学示范中心等3个省级实验教学示范中心，口腔颌面外科学、临床护理学、医学影像学、医学形态学、儿科学等5个省级教学团队，医学免疫学为省级双语教学示范课程，面向蓝黄经济区生物医药技术专业人才培养模式创新实验区为省级人才培养模式创新实验区。