学校依托办学优势，逐步建成了具有鲜明特色的科技创新体系。拥有江西省唯一独立组建的省部共建国家重点实验室；建有国家工程实验室、国家地方联合工程实验室、教育部重点实验室、农业部重点实验室等高层次科技创新平台；建有10个省级重点实验室（工程技术研究中心）、3个省级工程实验室（研究中心）、4个省高校重点实验室、2个省高校高水平实验室（工程中心）；1个省哲学社会科学重点研究基地、2个省高校人文社科重点研究基地、1个省软科学重点研究基地，1个省文化艺术科学重点研究基地。学校大力推进协同创新能力建设，作为核心协同单位组建国家“2011协同创新中心”1个、获批认定江西省“2011协同创新中心”5个。拥有国家级新农村发展研究院。建有2个国家级实验教学示范中心。
学校坚持以育人为中心，教学、科研共同发展，在人才培养、科学研究、社会服务、文化传承创新等方面取得优异成绩。建校以来，累计培养各类毕业生30余万人，大多数成为生产、经营、管理和农业技术推广等领域的骨干力量和领导干部。据不完全统计，学校培养的学生中，涌现了6名院士，1名共和国部长，12名省部级领导干部，30多位大学党委书记、校长，100多位国家有突出贡献专家、全国劳动模范、模范教师。目前全省100个县市区中有30位县（市）委书记、县（市）长为农大毕业生。
学校主动对接经济社会与地方产业发展，与全省80%以上县市区建立了科技合作关系，以重大产业项目为载体，先后推广了一大批拥有自主知识产权的优良品种及现代农业技术。“十二五”以来，学校共获得各级各类科技奖励95项，其中国家技术发明二等奖1项，国家科技进步特等奖1项、二等奖2项。
在新的历史时期，学校坚持人才强校、质量立校、特色兴校，大力推进有特色高水平大学建设，努力为科教兴国和人才强国战略、为“发展升级、小康提速、绿色崛起、实干兴赣”作出新的更大贡献。
