学校建有庐山文化研究中心、鄱阳湖生态经济研究中心、沿江产业开发研究中心、社会系统学研究中心、昌九一体双核发展研究中心、公共外交研究中心、国际农村医学教育研究中心、数控技术研究所等31个科研机构。学校大力推进“山江湖”学科建设工程，紧密围绕以庐山为地标的中华优秀传统文化、九江沿江产业开发与长江中游经济带建设、鄱阳湖生态经济区及生态文明示范区建设，形成了明显的优势和特色，产出了一批优秀研究成果。2016年，学校“庐山文化传承与传播协同创新中心”获批省级协同创新中心。近年来，学校不断加强内涵建设，开展卓越工程师培养、卓越医生培养、科技协同创新，服务地方经济社会发展。2016年，学校各类科研项目经费达3000多万元。

学校现有各类实验室（实验教学中心）28个。其中，5个省级重点实验室，5个省级实验教学中心、2个省高校人文社科重点研究基地，37个中央与地方共建基础实验室、中央与地方共建特色优势学科实验室；中央财政支持地方高校发展资金项目。现有教学科研仪器设备总值2.2亿余元。建有庐山实习培训中心等校内外实习基地200余个。

学校的计算机网络覆盖全校，实现了教学科研、图书文献检索和办公管理的网络化和校园一卡通；图书馆设1个主馆和4个分馆，共藏纸质图书300万余册、电子图书200余万种。学校不断加强基础设施建设。教学楼、实验楼、图书馆、信息技术楼、田径运动场和室内体育馆、学生活动中心等分布于各个校区。

学校十分重视引进国外优质教育资源，借鉴国外先进的办学理念和办学模式。现已与美国、法国、英国、德国、芬兰、日本、俄罗斯、柬埔寨、新加坡、泰国、印度等10多个国家的高校及科研机构建立了稳定的合作与交流关系。现招收有来自世界各国的留学生200余人来校学习，并开展外国高校师生研修团来校文化体验活动。学校积极聘请外籍教师和邀请海外专家学者来校讲学。国际农村医学教育中心得到美国中华医学基金会（CMB）大力资助。学校被列入江西省“定向培养乡镇卫生院医学人才”的高校。学校作为国务院侨办华文教育基地，积极参与海外华文教师培训工作；学校积极创办海外“孔子学院”，2009年12月，学校同柬埔寨王家学院等合作建立了柬埔寨第一所孔子学院，时任国家副主席习近平出席了孔子学院揭牌仪式，并誉之为“中柬人文交流的里程碑”。柬埔寨孔子学院连年获国家汉办表彰。2016年10月，学校与美国萨凡纳州立大学合作建立的萨凡纳州立大学孔子学院揭牌成立。学校每年选派教师赴国外进修和讲学，选拔学生赴国外学习。2016年7月和9月，学校先后举办了“陶渊明与生态文明学术研讨会”和“首届长江公共外交高峰论坛”，得到了国内外广泛关注与好评。