学校现设有人文社科学部、理工学部和医学部，拥有12个学科门类的112个本科专业，2个国家重点学科（食品科学、材料物理与化学），1个国家重点（培育）学科（材料加工工程），8个学术类博士学位授权一级学科，45个学术类硕士学位授权一级学科，1种博士专业学位授权（临床医学）和18种硕士专业学位授权，11个博士后科研流动站。学校化学、临床医学、农业科学（含食品）3个学科进入美国ESI排名前1%。在全国第三轮一级学科整体水平评估中，食品科学与工程学科位列全国同类学科第4名。食品科学与工程专业1篇博士论文入选全国优秀博士学位论文，实现了江西省“全国百篇优博”零的突破。

学校是教育部普通高校本科教学工作水平评估优秀高校，具备扎实的办学基础。现有1个国家级教学团队（公共数学），1门国家级双语教学示范课程（基因工程），1个国家级虚拟仿真实验教学中心（工程力学）；2门国家级精品课程（现代汉语、高等数学），2个国家级大学生校外实践教育基地，4个国家实验教学示范中心，7门“十二五”国家级规划教材，9个国家级特色专业。学校医学教育已发展成为江西省医药卫生领域人才培养、科学研究、医疗保健和情报信息中心，设有4所三级甲等附属医院，共有9个国家临床重点专科。学校是教育部中国教育和科研计算机网（CERNET）江西主节点单位，是江西唯一一所校园网全面升级为IPV6并接入中国下一代互联网示范工程CNGI高校。《南昌大学学报》分文、理、医、工科版，其中文、理科版为中文核心期刊，医、工科版为科技核心期刊。2016年，学校荣获国家级教学成果二等奖2项。建校以来，学校共培养了40多万优秀人才，为国家和地方经济建设和社会进步作出了重要贡献。

学校现有1个国家重点实验室（食品科学与技术），1个国家工程技术中心（硅基LED），1个教育部人文社会科学重点研究基地（中国中部经济社会发展研究中心），6个江西省协同创新中心。2016年，学校获批国家自然科学基金项目211项（位列全国申报单位第25名），国家社科基金24项（位列全国高校第33名），并获批1项国家社会科学基金重大项目，实现了我校人文社会科学国家级重大项目零的突破。

学校协同创新能力不断增强，取得了一批原创性、标志性、有特色的科研成果。如FKBP12.6介导的心肌细胞肌质网钙释放在正常心脏和心脏疾病中的作用及其机制研究、硅衬底GaN基发光二极管、过敏性疾病尘螨变应原的基础研究及其诊断试剂盒的研制、稻米营养方便食品及其加工副产品深加工关键技术和产业化、高速铁路数字化测量系统、南方离子型稀土矿资源高效利用和绿色分离等。学校还与地方政府、企事业单位开展全方位、多层次的合作，不断推进政产学研用紧密结合。