学校拥有教育部“长江学者”特聘教授5人、讲座教授5人，中组部“千人计划”1人，百千万人才工程2人，“万人计划”1人，教育部优秀跨世纪人才1人，中宣部文化名家暨“四个一批”人才1人，享受政府特殊津贴专家8人、省部级有突出贡献中青年专家6人、教育部“新世纪优秀人才支持计划”3人、全国审计专业学位硕士研究生教学指导委员会委员1人、教育部教学指导委员会委员5人、财政部全国领军（后备）人才（学术类）3人、司法部“全国优秀教师”1人、江苏省青年科学家奖1人、江苏省优秀社会科学工作者1人、江苏省“双创计划”人才2人、江苏特聘教授3人、江苏省教学名师1人；江苏省“333人才工程”培养对象54人（其中第二层次6人），江苏省“六大人才高峰”培养对象14人；江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人36人、“青蓝工程”优秀青年骨干教师77人；江苏省优秀教育工作者4人；审计署先进集体2个，先进个人2人；获得全国五一劳动奖章1人；江苏青年社科英才1人；省级劳动模范1人。“现代审计理论与方法研究”、“区域金融创新研究”、“价值链分工的经济效应研究”、“马克思主义与当代中国学术发展研究”、“金融定量分析与数据处理”等江苏省“青蓝工程”科技创新团队5个。

学校拥有“现代审计发展研究中心”、“金融风险管理研究中心 ”等江苏省高校哲学社会科学研究基地2个，“审计信息工程与技术”江苏省高校协同创新中心（培育点）1个，“公共工程审计”、“审计信息工程”、“金融工程”和“江苏省审计大数据工程实验室”等省级重点实验室4个。近五年来，学校主持包括国家社科基金重大招标项目在内的国家社科基金、国家自然科学基金项目94项，省部级科研项目147项，参与了审计署重要政策和法律法规建设工作以及审计学科建设等重大理论课题的攻关。在《JournalofBusinessEthics》、《Energy Economics》、《经济研究》等权威期刊发表论文177篇，在CSSCI/CSCD以上刊物发表论文1322篇，出版学术专著100余部，获得包括教育部高等学校科学研究优秀成果奖（人文社科）一等奖和江苏省哲学社会科学优秀成果一等奖在内的省部级以上科研成果奖40项。

学校主办的《审计与经济研究》为全国中文核心期刊、CSSCI来源期刊、RCCSE中国核心学术期刊、全国高校“精品社科期刊”、人大复印报刊资料重要转载来源期刊。《南京审计大学学报》为全国高校“优秀社科期刊”、RCCSE中国核心学术期刊（扩展版）。