为推进教育国际化进程，学校先后与包括世界一流大学在内的近百所海外高校建立了密切的合作关系，开展各类交流合作。经国家教育部批准，学校与美国卡内基梅隆大学举办了中外合作办学项目，培养机器人专业硕士研究生;与德国慕尼黑工业大学等30多所海外知名高校签署了联合培养人才协议，每年选派200多名学生到海外短期学习交流或攻读学位。学校注重与境外高水平大学和科研机构开展科研合作，先后与俄罗斯乌法航空技术大学、白俄罗斯戈梅立国立大学等多所高校和科研机构建立了联合研究中心或实验室，每年来校开展合作研究、讲学等学术交流活动的境外专家学者达400人次之多。
为争取海内外各界对南京理工大学发展的关心和支持，学校于1994年成立了由多家政府机构和企事业单位组成的南京理工大学董事会，学校与董事单位形成深层次、长期稳定的合作关系，互利互惠、相互支持，实现了校企相互促进与和谐发展。为拓宽筹措办学资金渠道，凝聚各方兴学力量，学校于2006年成立了教育发展基金会，支持学校在人才培养、科学研究和社会服务领域不断追求卓越。每年社会各界通过基金会在学校设立各类奖教金、奖助学金40余项，受益师生千余人次。
新世纪，新征途，南京理工大学将继续发扬优良传统，抓住中华民族伟大复兴的历史机遇，与时俱进，开拓进取，知识传授与人格塑造并重，科研创新与技术转化兼行，以博大的胸襟，宽广的视野，务实的作风，求是的精神，坚定不移地朝着特色高水平研究型大学战略目标阔步前进。
学校现任党委书记陈根甫研究员，校长王晓锋教授。
