学校积极拓展国际合作，与美国耶鲁大学、威斯康星大学、夏威夷大学、佛罗里达州立大学、俄克拉荷马大学、德克萨斯农工大学，英国曼彻斯特大学、雷丁大学，加拿大多伦多大学，德国汉堡大学等15个国家的48所著名高校建立了人才培养、科学研究的合作关系。学校创办了巴哈马“孔子学院”，拥有中国政府、国家汉办、江苏省政府茉莉花奖学金等招收留学生资格。学校拥有“联合国世界气象组织区域培训中心”，已为140余个国家和地区培养了2200余名高级气象科技人员和管理者，成为全球培训规模最大、质量名列前茅的培训中心，受到世界气象组织的高度评价和特别嘉奖。
今日的南京信息工程大学秉持“开放发展、联合发展”的方针，继续深化改革，积极协同创新，努力提升人才培养质量和科技创新能力，为尽早成为“一流特色重点大学”而拼搏奋斗
