药物基因和蛋白筛选国家工程实验室是国家级实验室。植被生态科学实验室、多酸科学实验室、应用统计实验室、分子表观遗传学实验室、紫外光发射材料与技术实验室（在建）是教育部重点实验室，吉林省生态系统恢复与生态系统管理实验室是省部共建国家重点实验室培育基地，动力电池实验室是国家地方联合工程实验室。学校还设有教育部农业与医药基因工程研究中心、教育部数字化学习支撑技术工程研究中心（在建）、环境保护部国家环境保护湿地生态与植被恢复重点实验室、植物基因科学高等学校学科创新引智基地、微纳光电材料科学与技术高等学校学科创新引智基地以及国家国际科技合作基地——“人类干细胞库国际联合研究中心”。农村教育研究所和世界文明史研究中心是教育部人文社会科学重点研究基地。教育部在我校设立了高校辅导员培训和研修基地、全国妇联在我校设立了妇女/性别研究与培训基地女性研究中心。

国家基础教育实验中心、全国中小学教师继续教育东北师范大学研究中心、全国现代教育技术培训中心、中国赴日本国留学生预备学校、教育部幼儿园园长培训中心、教育部东北教育管理干部培训中心、教育部东北高师师资培训中心等全国性培训研究机构设在我校。学校还设有远程与继续教育学院，附属中学、附属小学、附属幼儿园和以出版教育类书籍而饮誉海内的高校出版社等。

东北师范大学拥有一批国内外著名的专家学者。在全校1489名专任教师中有教授451人，副教授522人，现有本校在岗博士生导师350人。有享誉海内外的第三世界科学院院士和历届国务院学位委员会学科评议组成员17人，“千人计划”2人，长江学者特聘教授7人，长江学者讲座教授4人，国家杰出青年基金获得者4人，国家级有突出贡献中青年专家3人，中国科学院“百人计划”入选者3人，教育部跨世纪（新世纪）优秀人才计划入选者69人，国家级教学名师4人。

近年来，学校在“尊重的教育”理念指引下，以教育教学为立校之本，根据人才培养目标的定位，积极探索人才培养模式改革。2003年，按照“宽口径、厚基础、精专业、多出路”的人才培养思路，大力进行教育教学改革，开始了新一轮本科教学改革工程。2005年，学校顺利通过教育部本科教学工作水平评估，获得优秀成绩。2007年，学校全面贯彻落实国家师范生免费教育政策，实施本硕一体的“3+0.5+0.5+2”的人才培养模式，启动了“教育家培养工程”。2008年在教育部、财政部“优势学科创新平台项目”的支持下，学校开始“教师教育创新平台项目”建设，把“教育家的摇篮”作为更高目标的追求。为提高教师教育质量，深化教师教育模式改革，学校在国内率先提出并践行了“师范大学—地方政府—中小学校”（U-G-S）三方合作的办学模式，构建了理论与实践高度融合的教师教育人才培养模式。截至，我校有7篇博士学位论文被评为全国优秀博士学位论文，17篇博士学位论文获得全国优秀博士学位论文提名奖。