学校积极开展校地、校企、校所合作模式，先后与农业部食物与营养发展研究所、中国农科院特产研究所、双辽市政府、大安市政府、吉林市长白山生态农业产业商会等41家企事业单位签订了合作协议，为地方经济建设提供了智力和科技支持。学校也被确立为省级星火培训基地、农村干部培训基地和新型农民培训基地。学校与浙江吉利汽车有限公司广泛开展校企合作，与企业联合建立“吉利班”。学校与上市公司珠海世纪鼎利通信科技股份有限公司签订校企合作协议，双方各投资4000万元共建吉林农业科技学院鼎利学院，充分发挥双方的人才培养和技能实训优势，将在农业物联网、移动互联网、电子商务、智能制造等高新技术产业领域开展合作，共建“产教融合”实训基地，共同培养高素质应用型人才，实现校企合作、产教整合的目的。

学校重视“三创”工作，不断加强对大学生创新、创意、创业能力培养和就业工作的指导与服务，把学科竞赛和创新学分记入人才培养方案。我校学生在各级各类学科竞赛中均取得优异成绩。，我校代表队在全国商业精英挑战赛流通业经营模拟大赛中获一等奖并代表大陆参加亚太地区决赛，获得第三名的好成绩。学校和内蒙古蒙牛乳业集团、南京雨润集团、沈阳禾丰牧业股份有限公司、北京大北农科技集团等国内大中型企业集团建立了200多个大学生就业创业基地，毕业生就业质量不断提高，部分学生创业积极性较高，取得了较好的创业佳绩。

学校建有“农业部国家糖料加工技术研发分中心”、“酿造技术吉林省科技创新中心”、“酿造技术吉林省高等学校工程研究中心”、“长白山动植物资源保护与利用省级重点实验室”、“长白山生态优质农产品研发中心”、“农业部农产品质量与营养功能风险评估实验室（吉林）”各一个，基础和专业实验室121个。学校建有农场、猪场、鸡场、鹿场、药用植物种源基地、葡萄酒厂、实习宾馆、实习工厂和大学生超市等20个校内实习基地，260个稳定的校外实习基地。2007年被确立为“吉林省大学生创新实践基地”，左家校区实践教学基地先后被评为吉林省科普教育基地和国家级科普教育基地。2011年，学校被省科技厅确立为星火培训基地，被吉林市政府评为送科技下乡先进集体，学校多次被评为“吉林省科教兴农先进单位”、“吉林省精神文明建设先进单位”等多项荣誉称号。7月，被国家食物营养与咨询委员会确定为“国家食物与营养教育示范基地”。