海昏侯墓并非“完璧之身”，考古工作者在发掘过程中发现了两个盗洞。其中一个是2011年被村民发现的，深约14米，直通主椁室的中心位置。但万幸的是，棺椁外层覆盖了多层木头保护，盗墓贼没能打通，且主棺并不在椁室正中。另一个则在墓室的西北角，洞内留下一盏五代时期的灯具，考古专家据此判断其为古代盗洞。但五代的盗墓贼也没能进入主椁室，仅仅损坏了西北角的几个漆箱。
据史料记载，东晋时期江西曾发生一场大地震。这为海昏侯墓提供了天然屏障。公元318年发生在豫章郡的大地震，使原来的海昏县等豫章古县淹没到鄱阳湖中，也让海昏侯墓墓室坍塌，被地下水淹没。而当时人们不具备水下盗墓的条件，所以该墓得以幸免。
谜团三
如何确定海昏侯墓的“真身”？
海昏侯墓园中有两座主墓、七座祔葬墓和一座车马坑，那么如何判断哪座墓才是海昏侯本人呢？
封土堆是最主要的判断依据。海昏侯墓封土堆上覆盖的杂草、灌木、荆棘非常浓密，从外观上看，其封土堆比左侧侯夫人墓显得小一些。但考古专家们分析，汉代以右为尊，右侧封土堆下的墓主人可能更尊贵。果然，当考古队对两个封土堆的地表进行清理后发现，西汉海昏侯墓的封土堆明显要比侯夫人墓封土堆大，而且夯土、祭台等也都比左边的大。
谜团四
椁室为什么看着像“豪宅”？
海昏侯墓结构呈居室化倾向，是目前发现的最早的使用汉代葬制的西汉列侯墓。其椁室面积达400平方米，由甬道、东西车库、回廊形藏閤、主椁室构成，布局完整，说其像一座地下“豪宅”一点也不夸张。
回廊的功能分区十分清晰：北回廊按功能区分为衣笥库、钱库、粮库、乐器库、酒具库；西回廊按功能区分为武库、文书档案库、娱乐用器库；东回廊按功能区分为厨具库；南回廊甬道两侧为车马库；甬道按功能区分为乐车库。此外，每个功能分区均发现有属遣策一类的带有文字的木牍和各式造型的青铜灯。说明这位海昏侯不仅“豪”，而且很有文化。
谜团五
和马王堆汉墓比，谁的考古价值更高？
在此前发掘的西汉列侯等级墓葬中，以长沙马王堆汉墓最受关注。
从墓葬的保存情况来看，海昏侯墓葬更胜一筹。国家文物局特派专家组对海昏侯墓葬的评价是“我国迄今发现的保存最好、结构最完整、功能布局最清晰、拥有最完备祭祀体系的西汉列侯墓园”。但是，马王堆汉墓的墓园没有保存下来。
