明孝陵的后山还埋葬着一批明朝的开国功臣，有著名的中山王徐达、开平王常遇春墓等。据传，朱元璋营建明孝陵时，曾说过他一人独居钟山之阳，功臣陪葬山阴。因此，在紫金山之阴就有了11座功臣墓。这又恰似群星朝北斗。风水学认为，朱元璋留存孙权墓并非像简单传说那样仅因孙权是好汉，而是因为孙权墓所在的梅花山孙陵岗还在古地貌学上是一个近案，通俗地说，就像一张茶几。这样一来，明孝陵背倚钟山，从整体上就又形成背有靠，前有案，东有青龙，西有白虎，北有玄武(龟蛇合体)，南有朱雀的吉祥格局。也许，朱元璋这才称心如意。

　　2003年7月，在第27届世界遗产大会上，明孝陵作为明清皇家陵寝扩展项目被列入《世界遗产名录》，成为世界遗产成员。世界遗产委员会是这样评价明孝陵的：明清皇家陵寝依照风水理论，精心选址，将数量众多的建筑物巧妙地安置于地下。它是人类改造自然的产物，体现了传统的建筑和装饰思想，阐释了封建中国持续五百余年的世界观与权力观。

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　　孝陵如此恢弘的建筑，对于朱元璋这种将死后看得重如生前的人，地宫一定是非常可观的。但是，限于目前的科技手段和法律，孝陵是不能发掘的，那么孝陵的地宫情况能否知道呢?最近，传来一个令人兴奋的消息孝陵的地宫状况和结构基本探察清楚了。

　　江苏省地震工程研究院精密磁测(GPM)研究室主任、物探专家叫张治天，他率领一个工作组，采用精密磁测技术对明孝陵陵区2万平方米的区域进行了大规模的探测，终于揭开了一个隐藏达600余年的谜团一明孝陵确系明开国皇帝朱元璋的陵寝，并弄清了地宫的形制、地下埋藏物的基本分布情况等。

　　张治天等人依据的理论是地磁理论。这个理论认为空间的一切物质都有各自的磁场，金属带有磁性，就是非金属如砖瓦等其实也会带有磁性。况且，自然界中不同年代的土壤、砖石等，都有各自固定的磁场，因此，精密磁测技术就是利用物体磁场发布这种原理，来寻找地下分布物的一种探测方法。这种方法不仅可以探测到50 、 60米以下地下分布物，甚至可以用这种方法探测出经人为扰动的不同时期埋土的磁场异常。

　　就是在信号极弱、强干扰的情况下探测也有效。后来，我才知道，这次对明孝陵的探测就有一定的难度，其一、探测的范围与规模大，且史料上对朱元璋墓地的记载不确;其二、墓地周边区域具有强大磁场的干扰。但他们依然获得令人信服的探测结果。

　　据了解，江苏省地震工程研究院的物探专家们采用精密磁测技术曾经先后在寻找苏州吴王墓、南京宁河王邓愈墓、镇江地下城、丹阳景陵梁武帝墓以及对陕西咸阳沙河西汉木桥年代的确认上，都做出了贡献。

　　相传明太祖朱元璋死后，为了防止后人盗墓，曾于同一天从南京十三个城门同时出殡，而且车马仪仗完全相同，使人难辨真伪。所以，有传说孝陵的地宫中是空的，朱元璋并没有真的在这里安葬。民间还有朱元璋真身葬于南京朝天宫或北京万岁山的说法。他们的成果融合进了南京大学与中山陵园世界遗产明孝陵综合研究科研合作协议之中，得出的成果是：

　　排除地宫被盗之说

　　据有关文献记载，位于独龙阜下的明孝陵玄宫内埋葬着朱元璋本人及马皇后和成穆贵妃孙氏。关于朱元璋的地下宫殿建筑，由于史书失载，又缺乏必要的工程档案资料，加之在民间还有朱元璋葬于南京朝天宫或北京万岁山以及下葬时13个城门出殡等历史记载和传说，所以，几百年来，一直成为人们心目中的一个谜。