李宁团队曾创造了多项世界和全国第一：如世界最大的克隆牛、中国第一头克隆猪等。不可否认，他对科研进步的贡献卓著，成就斐然。一位中国农大知情的同事说。
　　仅中国农大生命科学研究中心的数据显示，2006年至2010年的5年间，国际论文、省部级奖项等学术产出中，李宁占据其所在院系全部奖项的一半多。与之相应的是，其获得经费的吸金能力在业内也屈指可数。
　　同一时期，李宁所在的生物学院获得科研项目达374个，获得国家及各类经费达6.8亿余元。
　　李宁最受争议的，就是他既是专项主要负责人、把关者，也是数十个子项目的负责人或顾问。一位知情专家表示。
　　21世纪教育研究院副院长熊丙奇认为，科研项目从立项、经费管理到项目评价，整个环节由行政部门主导，重立项、轻研究倾向普遍存在，身兼运动员裁判员是一批课题的普遍做法，以强化个人拿项目、抢经费的能力。
　　参股或控股开办多家企业，壳公司捞钱致出事
　　记者调查了解到，长期担任重大课题负责人、国家重点实验室主任的李宁，还参股或控股开办了多家企业。正是通过壳公司参与课题、捞取公款，直接导致其出事。
　　根据工商登记资料，李宁名下企业分布在北京、无锡等地。成立于2009年1月19日、注册资本为1000万元的北京三元济普霖生物技术有限公司，就是一家以李宁为法人的公司。
　　记者按济普霖公司发布的招聘地址查询，发现其址就在中国农大附近一处居民楼中。周边居民说，根本不知道有这家公司存在。而公司登记、公布的两部电话一部为空号，另一部无人接听。
　　就是这家只见其名难觅其踪的企业，却屡屡参与李宁承接的国家课题，进而获得国家经费。检索论文库发现，李宁共刊发核心以上期刊论文500余篇。以中国养殖可持续发展等课题名义刊发的论文中，济普霖公司名列参与者。不完全统计，济普霖公司参与的类似课题项目有近20项。
　　根据巡视整改通报，李宁等人承担的、农业部牵头组织实施的转基因生物新品种培育重大专项有关课题，正是套取经费事发的导火索。尽管被侵吞的具体金额尚未公布，但记者在一份《转基因生物新品种培育科技重大专项重点课题申报指南》中看到，该科研专项旗下单个子项目的规模为200万元至300万元。同时承接多个项目的济普霖公司，掌握的经费估计至少上千万元。
　　知情人士介绍，与多数专家与学生团队一同承接课题、使用经费不同，李宁采取的专业化公司、专业化运作近来十分流行。名义上是有利于课题的专业性、延续性，实际上，便于开票报账也是重要目的。
　　一位省级涉科研部门的经费管理办公室负责人坦言，上述做法不是孤例。这几年企业参与省里科研项目的不少，但效果待观察。像上市公司那么大的账目流水，很容易以各种科研名目报销掉几百上千万元的经费，甚至查出有企业将经费挪用在房地产上，简直把基层科研经费当个‘筐’，是啥都敢往里装。
　　个案折射制度性漏洞
　　针对李宁涉案，记者多次联系中国农业大学校办负责人，办公电话均无人应答。而中国农大生命科学研究中心办公室负责人连用三个不知道来回答：不知道院士归谁管，不知道领导在哪里，不知道李宁个人任何情况，我们只提供研究场地，李宁级别太高，我们管不了。
　　李宁涉案令很多师生和专家惋惜。中国农业大学一位硕士生称，李宁身为院士，还长期坚持为普通学生授课，实属少有。还有多位业内专家表示，生于江西的李宁，求学时是典型学术痴，其作出的重要科研贡献不能因其贪腐行为而被全盘否定。