一些日本的物理学家也对美军使用核裂变弹怀疑，因为他们不相信美国拥有核裂变武器。但是日本最有名的核物理学家之一西名吉尾却知道美国已经完全有可能掌握了原子弹，他相信日本已经遭受到美国的原子武器的攻击，对此他忧心忡忡。
正当曼哈顿2行动还在进行时，6日晚，美国总统杜鲁门向全世界发布了令人吃惊的消息，美军在广岛投下了原子弹，并向人们介绍了这种最新武器的强大威力，相当于1.5万吨TNT，广岛已经消失了，这个消息迅速的传到世界各地，包括传到日本以及所占领的地区。世界一片沸腾，很少人知道这颗原子弹是信息战的结果。
但是，日本在这时却没有显露出任何将要投降的迹象，这令美国军方十分恼火，甚至着手准备使用真正的原子弹轰炸日本。这当然遭到了许多人的反对，他们认为这是正常现象，应该实行第二步计划。
1945年8月9日，日本还被一片恐怖笼罩时，又一颗原子弹在日本爆炸了--美军开始了第二次大规模的信息迷惑，这次更加猛烈，因为长崎已经被美军的军舰给完全封锁了，联人与人的直接通讯的条件都没有，美军又给日本各地传送信息长崎被原子弹轰炸，长崎消失了。日本国民真正的开始陷入混乱局面。
当晚，美国总统杜鲁门又向外界宣布美军在日本长崎投下了一颗原子弹，这次，他向大家展示了更令人吃惊的新闻--在长崎和广岛原子弹爆炸电影资料，当然，实际上是在新墨西哥州爆炸的原子弹的电影资料，只是角度不同，另外还有美军用模型制作的广岛和长崎被原子弹轰炸后的电影资料，在黑白电影中很难分辨真假。
电影资料被展示后，全世界为之震惊，各大报都在头版刊登了原子弹爆炸的照片和广岛、长崎被毁灭的照片。
日本国内已经陷入完全混乱。
同时，几位原子科学家，包括阿尔瓦雷斯、阿格纽、罗伯特*瑟伯尔等人通过他们的日本朋友给日本政府了一封信，信中详细的讲述了原子弹的巨大威力，并劝日本政府马上投降。
1945年8月11日，日本通过第三国向美国政府表示了投降意愿，不过是有条件投降。美军也知道了这场信息战实际取得了成功。但是不接受日本的有条件投降方案，要求日本马上无条件投降。
1945年8月13日，美军对日本下达了最后通牒，若不马上投降，将在东京投放原子弹。当然，这颗将是一颗真正的原子弹。
1945年8月14日，日本表示将接受波茨坦公告，即将投降。
1945年8月15 日，日本天皇宣布无条件投降。
这次信息迷惑战在神不知鬼不觉中胜利了。
三 结局与尾声
曼哈顿2行动实际上已经取得了成功。但是，这个计划一直被严格的保密。联参加行动的绝大多数军人也不知道他们行动的全部过程。他们只知道把信息传到日本各地，他们也认为美军在日本投下了原子弹。美军的信息迷惑甚至迷惑了大多数美军，实际上是迷惑了全世界。
日本投降以后，美军完全而且是单独的占领了日本，并且控制了日本的新闻和通讯等信息机构，完全控制了日本官方。日本绝大多数人不知道广岛和长崎仍然存在，甚至是平安无事。而知道真相的人却没法传送消息，如果那时你是说广岛和长崎平安无事的话，肯定被认为是疯子。
几个月后，在美军的操纵下，日本政府公布广岛和长崎原子弹爆炸造成共30万人死亡。
为了防止日本和德国的军国主义复活，主要是为了威胁国际共产主义运动，美国没有公布事件真相。美国销毁了所有曼哈顿2计划资料，从而无法再让人知道事实和真相。
日本政府也对此有过怀疑，但是因为美国的压力和自身利益，没有追究下去。
战后不久，日本政府发现这了两颗原子弹却有巨大的利用价值，可以掩盖日本害人国的地位，突出其被害国的地位，所以日本不愿再怀疑那两颗原子弹。现在，每年的8月6日和9日，在日本广岛和长崎，都有纪念活动，纪念从未有过的原子弹爆炸，在两地还有纪念馆，以突出日本在历史上的被害，但是却从未反省自己对亚洲和世界各国人民犯下的罪行。