2012年8月2013年7月，美国哈佛大学燕京学社访问学者。
1990年厦门大学人类学系助教，1991年超前破格讲师，1995年历史系选优副教授，2000年教授，2002年博士生导师，2013年特聘教授。
1993年厦门大学人类学系考古教研室主任，2004年海洋考古学研究中心主任，2009年考古人类学实验教学中心主任，2012年考古学博士后流动站负责人。

2000年福建省第四届社会科学优秀成果三等奖，2002年福建省第二届优秀青年社科工作者（十佳提名），2003年福建省第五届社会科学优秀成果三等奖，2004年福建省第三届优秀青年社科工作者（十佳），2005年厦门大学新世纪优秀人才资助计划，2005年福建省第六届社会科学优秀成果一等奖、三等奖，2005年福建省百千万人才工程，2009年福建省第八届社会科学优秀成果三等奖，2009年福建省教学成果二等奖，2009年厦门大学教学成果一等奖，2010年全国台湾研究会第三届台湾研究优秀论文三等奖，2011年福建省第七届教学名师奖，2011年入选教育部新世纪优秀人才支持计划，2011年全国宝钢优秀教师奖，2013年福建省优秀教学成果一等奖，2013年福建省第十届社会科学优秀成果二等奖。

主持国家级科研项目有，教育部八五规划先秦两汉时期东南沿海地区考古学文化研究（1993-1996），教育部九五规划专项任务福州城市考古研究（1997-1999），国家社科基金十五规划闽台土著民族关系与‘南岛语族’起源（2001-2004），教育部十五规划环中国海沉船与海洋考古研究（2001-2004），教育部重点研究基地重大项目台湾原住民研究（2006-2010），国家社科基金重大项目环中国海海洋文化遗产调查研究（2010-2015）。