近5年，学校承担了国家自然科学基金项目、国家哲学社会科学基金项目、国家科技支撑计划项目、教育部项目等纵向项目812项，各类横向项目179项，申请发明专利和实用新型专利351件，授权95项。科研成果先后获得省部级以上奖励163项，出版著作361部,发表论文7617篇，被SCI、EI、ISTP收录论文1863篇。学校公开编辑出版《商业研究》、《哈尔滨商业大学学报(自然科学版)》、《哈尔滨商业大学学报(社会科学版)》等3种学术期刊，其中《商业研究》为全国中文核心期刊。

学校高度注重国际交流合作工作。学校先后与24个国家和地区的46所院校建立了友好合作关系。与英国利兹大学、爱丁堡龙比亚大学开展2+2、3+1+1联合培养本科生、硕士生项目。与美国中央阿肯色大学、俄罗斯远东联邦大学、日本东京海洋大学、韩国湖南大学等院校开展本科学生互换交流项目，已有亚洲、非洲、南美洲和加勒比海地区、南太平洋地区和独联体共52个国家的学员来校学习和培训。与俄罗斯的新西伯利亚国立技术大学、太平洋国立经济大学以及澳大利亚皇家理工大学、美国普度大学、日本东京海洋大学、韩国灵山大学等开展了多项科研合作。