学校现有教育部重点实验室1个，国家中医药管理局重点研究室3个，国家中医药管理局三级实验室10个，省重点实验室3个，省普通高等学校重点实验室4个，黑龙江省校企合作工程技术中心2个，科技部中医药国际科技合作基地1个，国家中医药管理局中医药国际科技合作基地1个，黑龙江省中医药国际科技合作基地1个，黑龙江省科技创新平台1个。现为国家“973计划”项目首席科学家单位。“十五”以来，获得各级各类科研课题立项2418项，其中国家“973”项目4项、“863”项目1项；获得各级各类奖励806项，其中国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖8项、高等学校科学研究优秀成果奖（自然科学类）一等奖1项、高等学校科学研究优秀成果奖（科技进步类）一等奖1项、中国中西医结合学会科学技术奖一等奖5项、黑龙江省科学技术奖（自然科学类）一等奖6项、黑龙江省科学技术奖（科技进步类）一等奖6项，黑龙江省科学技术奖（技术发明类）一等奖1项。学校培养的博士撰写的论文分别于2008年和2012年获得教育部、国务院学位委员会“全国优秀博士学位论文”。在中药血清药物化学研究、中药天然药物药效物质基础研究方面处于国际先进水平，在方剂配伍规律、针灸作用机理研究和中医药治疗内科、妇科、肾病等重大疾病的临床研究方面处于国内领先水平。

学校附属第一医院（临床医学院）为国家中医临床研究基地建设单位、国家三级甲等医院、全国示范中医医院。学校附属第二医院（针灸推拿学院）是我省首家获得国家药物临床试验机构认定的中医院，为全国首批现代化中医院建设单位。两附院有国家重点专科20个、省重点专科30个。

学校现有教职工3184人（校本部1181人）。其中教授、副教授及相应职称人员887名，博士生导师114人，硕士生导师375人，有45位专家享受政府特殊津贴，卫生部有突出贡献中青年专家2名，百千万人才工程国家级人选4人，国医大师1名，国家教学名师3名，全国先进工作者2名，全国优秀科技工作者1名，巾帼建功标兵1名，全国模范教师1名，全国优秀教师6名，现有长江学者讲座教授1人，龙江学者特聘教授13人，“千人计划”入选者1人，国家教学团队3个，省教学团队5个，省教育厅科技创新团队7个。