自2000年初开始，学院由政府与企业联办。联办改制以来，学院不仅在规模上实现了快速发展，而且办学条件不断改善，办学质量不断提高。从2001年起，学院在历年全省高职高专办学条件与教学质量检查中、在全省高校实验室与图书馆建设评估中，都得到省教育厅的充分肯定与表彰。2005年12月，学院接受全国高职高专人才培养工作水平评估，评定为“优秀”等级，这是海南迄今唯一获得优秀等级的专科院校。学院的计算机、公共英语等级考试通过率，包括2001年以来的大学生英语口语历次演讲比赛，学生成绩一直名列前茅。2006年5月，全省思想政治理论课公开教学比赛，我院教师王莹、陈玉书分别获得专科组第一名和第二名。2007年12月，学院接受省教育工委思想政治理论课建设评估，又被评为“优秀”等级。海南省人事劳动保障厅2003—2007年连续五年公布的学院毕业生初次就业率都在94%以上，位居全省高校之首，2006年，被评为“海南省普通高等学校毕业生就业工作评估优秀单位”。学院党委曾三次被评为“先进基层党组织”；其事迹被编入《先进性在海口》一书中。2007年4月,设在学院的“海南省第五十八职业技能鉴定所”荣获“全国优秀职业技能鉴定所”称号。可以说，历经八年的不懈努力，学院已经打下了较为厚实的办学基础，各个方面都取得了显著成绩，业已成为海南高职院校的“领头羊”，大特区高等教育改革与创新的一面旗帜。

学院坚持“科研兴校”的发展思路，成立了科研处、高教研究室和经济、旅游、艺术与现代汉语诗歌研究所（中心）；在海南高校中率先与省社科联共建了“海南省旅游商品研究基地”；各二级学院在自主创新的同时，积极与校外产业界在科研领域里密切合作，很快形成了较为系统、具有特色的科研网络，综合科研成果显著。近几来教师公开出版学术专著和教材52部，自编教材37部；共发表论文960多篇，其中在中文核心期刊发表53篇，被SCI、EI检索的论文有9篇；在厅级以上学术会议上交流论文174篇；已立项的省级科研项目53项，其中中国高等教育学会“十一五”规划课题立项的有4项；获奖的著作、论文、艺术作品、多媒体课件有228部、篇（件），其中获省级一等奖以上43项。董事长曹成杰与傅治平教授合作的专著《教育中人的发现》获全国第六次高校优秀科研成果三等奖；李卫东副教授的《试析中国职业教育面临的压力与挑战》获海南省职教科研成果一等奖。校园文化建设不断加强。学院出版有《海口经济学院学报》、《高教研究通讯》、《海口经济学院报》、《竹根泉》等报刊。在2006年全国高职高专学报年会上，学院学报荣获优秀学报二等奖。