1998年以来,学校承担厅局级以上自然科学研究课题981项,其中国家级28项,省部级302项,厅局级468项,横向课题29项;获省级以上科技进步奖81项,其中国家级1项。学校教师主编、副主编及参编各类专著、教材30部。在省级以上刊物发表论文8000多篇,其中国外杂志发表80多篇,并有博士学位论文入选2002年全国优秀博士学位论文(广西高校第一篇)。
学校国际交流与合作日益广泛,近五年来,有30多个国家和地区的300多名学者来我校进行学术交流和参观访问,先后派遣500多名教师和专业人员分别到20多个国家和地区留学、进修,参加国际会议、考察和讲学。
2002年,学校通过国家教育部本科教学工作水平评估,面貌焕然一新,教风、学风都上了新台阶。学校坚持以教学为中心,转变教育观念,深化教学改革和学校内部管理体制改革,提高教学质量,努力把广西医科大学建设成为学科齐全、教学手段先进、技术力量雄厚的现代化医科大学,为我国医学事业的发展做出新贡献。