科学研究：学校拥有国家重点实验室、国家临床医学研究中心各1个，也是国家创新人才培养示范基地和国家级国际科技合作基地。2004年以来，共承担科研项目5140项，获资助经费17亿元。学校作为第一完成单位获国家科技二等奖以上奖励6项，作为第一完成单位获省部级科技一等奖24项。2000年以来，我校有5项科研成果7次入选国家公布的年度科技十大新闻。
医疗实力：学校现有6所直属附属医院，床位总数超过7000张。拥有国家临床重点专科16个，国家中医药管理局重点学科6个、重点专科4个，广东省“十二五”医学重点学科7个，广东省临床重点专科54个，广东省医疗质量控制中心4个，建成了广东省肾脏病研究所、广东省骨科研究院。南方医院惠侨楼是全国首家、规模最大的涉外医疗中心，曾被中央军委授予“模范医疗惠侨科”荣誉称号，并得到江泽民同志亲笔题词嘉勉。
产业开发：自20世纪80年代以来，学校开创了全国高校产学研一体化先河，以自主研发的“三九胃泰”、“正天丸”、“无限极口服液”、“尿毒清”等产品为基础，先后创建了深圳南方制药厂（三九集团前身）、南方李锦记营养保健品有限公司、广州康臣药业有限公司等国际知名的医药企业。研制出了国际上第一个SARS抗原检测试剂盒、第一台国产“X－刀”、国家Ⅰ类新药B超心脏造影剂、地中海贫血诊断试剂盒等高端科研产品并成功实现产业化。
